RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359332.6

KLHDC1-201, Transcript of kelch domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KLHDC1, Length 2,691 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC1-201ENST00000359332 SHPRHQ149N8 1683 aa26.75■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 ADGRB1O14514 1584 aa26.74■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 IGHDP01880 384 aa26.74■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.74■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 PANK1Q8TE04 598 aa26.73■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.73■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.73■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 RUNDC1Q96C34 613 aa26.73■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 COG6Q9Y2V7 657 aa26.73■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 PDE3AQ14432 1141 aa26.72■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.72■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 CD109Q6YHK3 1445 aa26.71■■□□□ 1.87
KLHDC1-201ENST00000359332 MTHFSP49914 203 aa26.7■■□□□ 1.86
KLHDC1-201ENST00000359332 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.69■■□□□ 1.86
KLHDC1-201ENST00000359332 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.68■■□□□ 1.86
KLHDC1-201ENST00000359332 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.68■■□□□ 1.86
KLHDC1-201ENST00000359332 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.67■■□□□ 1.86
KLHDC1-201ENST00000359332 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.67■■□□□ 1.86
KLHDC1-201ENST00000359332 CFAP53Q96M91 514 aa26.66■■□□□ 1.86
KLHDC1-201ENST00000359332 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.66■■□□□ 1.86
KLHDC1-201ENST00000359332 ABCC3O15438 1527 aa26.66■■□□□ 1.86
KLHDC1-201ENST00000359332 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
KLHDC1-201ENST00000359332 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.64■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 EVC2Q86UK5 1308 aa26.63■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 GLI2P10070 1586 aa26.63■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 USP32Q8NFA0 1604 aa26.62■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.62■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 WDR63Q8IWG1 891 aa26.61■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 CABP2Q9NPB3 220 aa26.61■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 NFKBIBQ15653 356 aa26.6■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.6■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 TNNQ9UQP3 1299 aa26.6■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.59■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.59■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.58■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 RAPGEF3O95398 923 aa26.58■■□□□ 1.85
KLHDC1-201ENST00000359332 RLBP1P12271 317 aa26.57■■□□□ 1.84
KLHDC1-201ENST00000359332 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
KLHDC1-201ENST00000359332 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.57■■□□□ 1.84
KLHDC1-201ENST00000359332 CCDC27Q2M243 656 aa26.55■■□□□ 1.84
KLHDC1-201ENST00000359332 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.55■■□□□ 1.84
KLHDC1-201ENST00000359332 NSD2O96028 1365 aa26.54■■□□□ 1.84
KLHDC1-201ENST00000359332 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
KLHDC1-201ENST00000359332 STK26Q9P289 416 aa26.53■■□□□ 1.84
KLHDC1-201ENST00000359332 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.52■■□□□ 1.84
KLHDC1-201ENST00000359332 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.52■■□□□ 1.84
KLHDC1-201ENST00000359332 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.52■■□□□ 1.84
KLHDC1-201ENST00000359332 PIK3C2BO00750 1634 aa26.51■■□□□ 1.84
KLHDC1-201ENST00000359332 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
KLHDC1-201ENST00000359332 SEC24BO95487 1268 aa26.5■■□□□ 1.83
KLHDC1-201ENST00000359332 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
KLHDC1-201ENST00000359332 USP19O94966 1318 aa26.5■■□□□ 1.83
KLHDC1-201ENST00000359332 IDI1Q13907 227 aa26.5■■□□□ 1.83
KLHDC1-201ENST00000359332 A0A1W2PP64 1363 aa26.48■■□□□ 1.83
KLHDC1-201ENST00000359332 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
KLHDC1-201ENST00000359332 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.47■■□□□ 1.83
KLHDC1-201ENST00000359332 AAMPQ13685 434 aa26.47■■□□□ 1.83
KLHDC1-201ENST00000359332 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
KLHDC1-201ENST00000359332 OSCARQ8IYS5 282 aa26.45■■□□□ 1.83
KLHDC1-201ENST00000359332 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.45■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 GSE1Q14687 1217 aa26.45■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.44■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 ADGRB2O60241 1585 aa26.43■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 ABCC11Q96J66 1382 aa26.43■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 IL27Q8NEV9 243 aa26.42■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 NEO1Q92859 1461 aa26.42■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.41■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.4■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.39■■□□□ 1.82
KLHDC1-201ENST00000359332 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
KLHDC1-201ENST00000359332 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
KLHDC1-201ENST00000359332 PRAM1Q96QH2 718 aa26.39■■□□□ 1.81
KLHDC1-201ENST00000359332 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.39■■□□□ 1.81
KLHDC1-201ENST00000359332 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.39■■□□□ 1.81
KLHDC1-201ENST00000359332 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
KLHDC1-201ENST00000359332 POGKQ9P215 609 aa26.38■■□□□ 1.81
KLHDC1-201ENST00000359332 ZFYVE9O95405 1425 aa26.36■■□□□ 1.81
KLHDC1-201ENST00000359332 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.36■■□□□ 1.81
KLHDC1-201ENST00000359332 NLRP1Q9C000 1473 aa26.36■■□□□ 1.81
KLHDC1-201ENST00000359332 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.36■■□□□ 1.81
KLHDC1-201ENST00000359332 FYB1O15117 783 aa26.35■■□□□ 1.81
KLHDC1-201ENST00000359332 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.35■■□□□ 1.81
KLHDC1-201ENST00000359332 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms