RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 ABCC11Q96J66 1382 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 PTPRUQ92729 1446 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 DEKP35659 375 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 SIRT1Q96EB6 747 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 STK26Q9P289 416 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 TECPR2O15040 1411 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 C14orf37Q86TY3 774 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 NWD1Q149M9 1564 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 ZMYND15Q9H091 742 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 DLC1Q96QB1 1528 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 PTCH1Q13635 1447 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 CPS1P31327 1500 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 RBM10P98175 930 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 PRAM1Q96QH2 718 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-201ENST00000351328 STRCP1A6NGW2 1772 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 POGKQ9P215 609 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 USP47Q96K76 1375 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 TMEM94Q12767 1356 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 TESK2Q96S53 571 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.46□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
CS-201ENST00000351328 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 MSH6P52701 1360 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 EVC2Q86UK5 1308 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 TMF1P82094 1093 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 DCCP43146 1447 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 CERKQ8TCT0 537 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 ADGRB2O60241 1585 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 ATF3P18847 181 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 CDK19Q9BWU1 502 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 CDCA8Q53HL2 280 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 DISP3Q9P2K9 1392 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 CABP2Q9NPB3 220 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 SLAIN2Q9P270 581 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-201ENST00000351328 TOM1O60784 492 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-201ENST00000351328 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-201ENST00000351328 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-201ENST00000351328 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-201ENST00000351328 MST1RQ04912 1400 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-201ENST00000351328 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-201ENST00000351328 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-201ENST00000351328 NUTM2FA1L443 756 aa9.39□□□□□ -0.91
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