RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 MYOM1P52179 1685 aa8.33□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa8.33□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 DIP2AQ14689 1571 aa8.33□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 STK26Q9P289 416 aa8.33□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.33□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 BCANQ96GW7 911 aa8.32□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 MED14O60244 1454 aa8.32□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 METP08581 1390 aa8.32□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 CDCA8Q53HL2 280 aa8.32□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 ANP32CO43423 234 aa8.31□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 CPS1P31327 1500 aa8.31□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 TULP4Q9NRJ4 1543 aa8.31□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 ABCC11Q96J66 1382 aa8.3□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.3□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 PRAM1Q96QH2 718 aa8.3□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 TECPR2O15040 1411 aa8.3□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.29□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.29□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 POGKQ9P215 609 aa8.29□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 PTPRUQ92729 1446 aa8.28□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.28□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 TBX22Q9Y458 520 aa8.28□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.28□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 EVC2Q86UK5 1308 aa8.28□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 SIRT1Q96EB6 747 aa8.28□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa8.27□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.27□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 PANK3Q9H999 370 aa8.27□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 ROBO2Q9HCK4 1378 aa8.26□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 CCER2I3L3R5 266 aa8.26□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 PIK3R4Q99570 1358 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 ADGRB2O60241 1585 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 PTCH1Q13635 1447 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 CABP2Q9NPB3 220 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 CDK19Q9BWU1 502 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 TMC1Q8TDI8 760 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 USP54Q70EL1 1684 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 USP32Q8NFA0 1604 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 NWD1Q149M9 1564 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 KCNA4P22459 653 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.21□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.21□□□□□ -1.09
CCR6-201ENST00000341935 RALBP1Q15311 655 aa8.21□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.21□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa8.21□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 KCNA6P17658 529 aa8.2□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.2□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 STRCQ7RTU9 1775 aa8.2□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.2□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.2□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.2□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.2□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 HSPA2P54652 639 aa8.19□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 ITSN1Q15811 1721 aa8.19□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 ATP7BP35670 1465 aa8.19□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PP64 1363 aa8.19□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 CCDC184Q52MB2 194 aa8.19□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 FMN2Q9NZ56 1722 aa8.19□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 AKAP12Q02952 1782 aa8.18□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.18□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.18□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 CABP1Q9NZU7 370 aa8.18□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.18□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.18□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.17□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.17□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.17□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 MRS2Q9HD23 443 aa8.17□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.17□□□□□ -1.1
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