RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329286.6

RAB12-201, Transcript of RAB12, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB12, Length 2,137 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12-201ENST00000329286 RAPGEF3O95398 923 aa40.61■■■■■ 4.09
RAB12-201ENST00000329286 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
RAB12-201ENST00000329286 MORC1Q86VD1 984 aa40.6■■■■■ 4.09
RAB12-201ENST00000329286 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
RAB12-201ENST00000329286 TULP4Q9NRJ4 1543 aa40.58■■■■■ 4.09
RAB12-201ENST00000329286 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
RAB12-201ENST00000329286 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.55■■■■■ 4.08
RAB12-201ENST00000329286 SKAP1Q86WV1 359 aa40.55■■■■■ 4.08
RAB12-201ENST00000329286 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
RAB12-201ENST00000329286 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.52■■■■■ 4.08
RAB12-201ENST00000329286 CGNL1Q0VF96 1302 aa40.51■■■■■ 4.08
RAB12-201ENST00000329286 WWC1Q8IX03 1113 aa40.5■■■■■ 4.07
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RAB12-201ENST00000329286 EVC2Q86UK5 1308 aa40.5■■■■■ 4.07
RAB12-201ENST00000329286 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa40.48■■■■■ 4.07
RAB12-201ENST00000329286 BCAR3O75815 825 aa40.47■■■■■ 4.07
RAB12-201ENST00000329286 NSD2O96028 1365 aa40.46■■■■■ 4.07
RAB12-201ENST00000329286 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
RAB12-201ENST00000329286 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
RAB12-201ENST00000329286 RUNDC1Q96C34 613 aa40.44■■■■■ 4.06
RAB12-201ENST00000329286 IDI1Q13907 227 aa40.42■■■■■ 4.06
RAB12-201ENST00000329286 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.42■■■■■ 4.06
RAB12-201ENST00000329286 NINLQ9Y2I6 1382 aa40.41■■■■■ 4.06
RAB12-201ENST00000329286 NBR1Q14596 966 aa40.4■■■■■ 4.06
RAB12-201ENST00000329286 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
RAB12-201ENST00000329286 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.4■■■■■ 4.06
RAB12-201ENST00000329286 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.4■■■■■ 4.06
RAB12-201ENST00000329286 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.39■■■■■ 4.06
RAB12-201ENST00000329286 MTHFSP49914 203 aa40.38■■■■■ 4.05
RAB12-201ENST00000329286 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.37■■■■■ 4.05
RAB12-201ENST00000329286 PDE3AQ14432 1141 aa40.35■■■■■ 4.05
RAB12-201ENST00000329286 CFAP53Q96M91 514 aa40.35■■■■■ 4.05
RAB12-201ENST00000329286 TCP11L2Q8N4U5 519 aa40.34■■■■■ 4.05
RAB12-201ENST00000329286 CABP2Q9NPB3 220 aa40.31■■■■■ 4.04
RAB12-201ENST00000329286 CCDC27Q2M243 656 aa40.3■■■■■ 4.04
RAB12-201ENST00000329286 WDR63Q8IWG1 891 aa40.29■■■■■ 4.04
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RAB12-201ENST00000329286 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
RAB12-201ENST00000329286 PTPRMP28827 1452 aa40.28■■■■■ 4.04
RAB12-201ENST00000329286 ABCC11Q96J66 1382 aa40.28■■■■■ 4.04
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RAB12-201ENST00000329286 FAM161AQ3B820 660 aa40.26■■■■■ 4.04
RAB12-201ENST00000329286 A0A1W2PP64 1363 aa40.26■■■■■ 4.04
RAB12-201ENST00000329286 NEUROD2Q15784 382 aa40.25■■■■■ 4.03
RAB12-201ENST00000329286 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
RAB12-201ENST00000329286 C8orf34Q49A92 452 aa40.24■■■■■ 4.03
RAB12-201ENST00000329286 DDRGK1Q96HY6 314 aa40.24■■■■■ 4.03
RAB12-201ENST00000329286 DEKP35659 375 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
RAB12-201ENST00000329286 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP40.21■■■■■ 4.03
RAB12-201ENST00000329286 RARSP54136 660 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
RAB12-201ENST00000329286 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa40.19■■■■■ 4.02
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RAB12-201ENST00000329286 ATAD2Q6PL18 1390 aa40.18■■■■■ 4.02
RAB12-201ENST00000329286 STK26Q9P289 416 aa40.18■■■■■ 4.02
RAB12-201ENST00000329286 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
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RAB12-201ENST00000329286 BCL11AQ9H165 835 aa40.16■■■■■ 4.02
RAB12-201ENST00000329286 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
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RAB12-201ENST00000329286 CD163L1Q9NR16 1453 aa40.13■■■■■ 4.02
RAB12-201ENST00000329286 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
RAB12-201ENST00000329286 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP40.13■■■■■ 4.01
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RAB12-201ENST00000329286 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
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RAB12-201ENST00000329286 AAMPQ13685 434 aa40.08■■■■■ 4.01
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RAB12-201ENST00000329286 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
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RAB12-201ENST00000329286 BCL2L13Q9BXK5 485 aa39.95■■■■□ 3.99
RAB12-201ENST00000329286 TNNQ9UQP3 1299 aa39.95■■■■□ 3.99
RAB12-201ENST00000329286 DLC1Q96QB1 1528 aa39.95■■■■□ 3.99
RAB12-201ENST00000329286 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
RAB12-201ENST00000329286 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.92■■■■□ 3.98
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