RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 C8orf37Q96NL8 207 aa29.14■■■□□ 2.26
CXCL3-201ENST00000296026 TECPR2O15040 1411 aa29.13■■■□□ 2.25
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.13■■■□□ 2.25
CXCL3-201ENST00000296026 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
CXCL3-201ENST00000296026 PIK3C2GO75747 1445 aa29.12■■■□□ 2.25
CXCL3-201ENST00000296026 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.12■■■□□ 2.25
CXCL3-201ENST00000296026 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL3-201ENST00000296026 ABCC11Q96J66 1382 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL3-201ENST00000296026 ADAMTS2O95450 1211 aa29.09■■■□□ 2.25
CXCL3-201ENST00000296026 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.08■■■□□ 2.25
CXCL3-201ENST00000296026 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL3-201ENST00000296026 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL3-201ENST00000296026 NGLY1Q96IV0 654 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL3-201ENST00000296026 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CXCL3-201ENST00000296026 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CXCL3-201ENST00000296026 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.04■■■□□ 2.24
CXCL3-201ENST00000296026 NUTM2FA1L443 756 aa29.04■■■□□ 2.24
CXCL3-201ENST00000296026 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.24
CXCL3-201ENST00000296026 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CXCL3-201ENST00000296026 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CXCL3-201ENST00000296026 FOXO3O43524 673 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL3-201ENST00000296026 PXDNQ92626 1479 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL3-201ENST00000296026 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29■■■□□ 2.23
CXCL3-201ENST00000296026 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CXCL3-201ENST00000296026 MYOM2P54296 1465 aa28.99■■■□□ 2.23
CXCL3-201ENST00000296026 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
CXCL3-201ENST00000296026 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.98■■■□□ 2.23
CXCL3-201ENST00000296026 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.98■■■□□ 2.23
CXCL3-201ENST00000296026 SIRT1Q96EB6 747 aa28.97■■■□□ 2.23
CXCL3-201ENST00000296026 RGS12O14924 1447 aa28.96■■■□□ 2.23
CXCL3-201ENST00000296026 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CXCL3-201ENST00000296026 USP21Q9UK80 565 aa28.95■■■□□ 2.22
CXCL3-201ENST00000296026 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CXCL3-201ENST00000296026 KIF1AQ12756 1690 aa28.91■■■□□ 2.22
CXCL3-201ENST00000296026 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CXCL3-201ENST00000296026 PRAM1Q96QH2 718 aa28.88■■■□□ 2.21
CXCL3-201ENST00000296026 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CXCL3-201ENST00000296026 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
CXCL3-201ENST00000296026 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CXCL3-201ENST00000296026 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-201ENST00000296026 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-201ENST00000296026 ATRNO75882 1429 aa28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-201ENST00000296026 DLC1Q96QB1 1528 aa28.84■■■□□ 2.21
CXCL3-201ENST00000296026 POGKQ9P215 609 aa28.83■■■□□ 2.21
CXCL3-201ENST00000296026 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.83■■■□□ 2.21
CXCL3-201ENST00000296026 ADGRB1O14514 1584 aa28.81■■■□□ 2.2
CXCL3-201ENST00000296026 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.81■■■□□ 2.2
CXCL3-201ENST00000296026 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.81■■■□□ 2.2
CXCL3-201ENST00000296026 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.8■■■□□ 2.2
CXCL3-201ENST00000296026 HRCP23327 699 aa28.78■■■□□ 2.2
CXCL3-201ENST00000296026 PSME1Q06323 249 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL3-201ENST00000296026 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL3-201ENST00000296026 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.76■■■□□ 2.19
CXCL3-201ENST00000296026 ADGRB2O60241 1585 aa28.75■■■□□ 2.19
CXCL3-201ENST00000296026 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.75■■■□□ 2.19
CXCL3-201ENST00000296026 USP32Q8NFA0 1604 aa28.74■■■□□ 2.19
CXCL3-201ENST00000296026 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.74■■■□□ 2.19
CXCL3-201ENST00000296026 STAC3Q96MF2 364 aa28.73■■■□□ 2.19
CXCL3-201ENST00000296026 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CXCL3-201ENST00000296026 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.72■■■□□ 2.19
CXCL3-201ENST00000296026 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CXCL3-201ENST00000296026 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CXCL3-201ENST00000296026 SBNO1A3KN83 1393 aa28.72■■■□□ 2.19
CXCL3-201ENST00000296026 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CXCL3-201ENST00000296026 SLIT2O94813 1529 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL3-201ENST00000296026 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
CXCL3-201ENST00000296026 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.7■■■□□ 2.18
CXCL3-201ENST00000296026 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.7■■■□□ 2.18
CXCL3-201ENST00000296026 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.7■■■□□ 2.18
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHG5O94827 1062 aa28.69■■■□□ 2.18
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF10O15013 1369 aa28.67■■■□□ 2.18
CXCL3-201ENST00000296026 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CXCL3-201ENST00000296026 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.65■■■□□ 2.18
CXCL3-201ENST00000296026 ABCA3Q99758 1704 aa28.64■■■□□ 2.18
CXCL3-201ENST00000296026 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.64■■■□□ 2.17
CXCL3-201ENST00000296026 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.64■■■□□ 2.17
CXCL3-201ENST00000296026 GLI3P10071 1580 aa28.63■■■□□ 2.17
CXCL3-201ENST00000296026 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CXCL3-201ENST00000296026 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CXCL3-201ENST00000296026 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.6■■■□□ 2.17
CXCL3-201ENST00000296026 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.6■■■□□ 2.17
CXCL3-201ENST00000296026 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.57■■■□□ 2.16
CXCL3-201ENST00000296026 VPS72Q15906 364 aa28.56■■■□□ 2.16
CXCL3-201ENST00000296026 ALS2Q96Q42 1657 aa28.56■■■□□ 2.16
CXCL3-201ENST00000296026 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CXCL3-201ENST00000296026 FAM83GA6ND36 823 aa28.54■■■□□ 2.16
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC125Q86Z20 511 aa28.54■■■□□ 2.16
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CXCL3-201ENST00000296026 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.51■■■□□ 2.15
CXCL3-201ENST00000296026 ITSN1Q15811 1721 aa28.51■■■□□ 2.15
CXCL3-201ENST00000296026 ATP7BP35670 1465 aa28.51■■■□□ 2.15
CXCL3-201ENST00000296026 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.5■■■□□ 2.15
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.5■■■□□ 2.15
CXCL3-201ENST00000296026 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CXCL3-201ENST00000296026 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
CXCL3-201ENST00000296026 CDK19Q9BWU1 502 aa28.47■■■□□ 2.15
CXCL3-201ENST00000296026 NRAPQ86VF7 1730 aa28.46■■■□□ 2.15
CXCL3-201ENST00000296026 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
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