RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.26■■□□□ 1.63
GDPD1-201ENST00000284116 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.26■■□□□ 1.63
GDPD1-201ENST00000284116 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
GDPD1-201ENST00000284116 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
GDPD1-201ENST00000284116 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.25■■□□□ 1.63
GDPD1-201ENST00000284116 PDE3BQ13370 1112 aa25.24■■□□□ 1.63
GDPD1-201ENST00000284116 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
GDPD1-201ENST00000284116 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.24■■□□□ 1.63
GDPD1-201ENST00000284116 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
GDPD1-201ENST00000284116 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GDPD1-201ENST00000284116 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
GDPD1-201ENST00000284116 ABCC11Q96J66 1382 aa25.22■■□□□ 1.63
GDPD1-201ENST00000284116 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.21■■□□□ 1.63
GDPD1-201ENST00000284116 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.2■■□□□ 1.63
GDPD1-201ENST00000284116 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.2■■□□□ 1.62
GDPD1-201ENST00000284116 MORC1Q86VD1 984 aa25.2■■□□□ 1.62
GDPD1-201ENST00000284116 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
GDPD1-201ENST00000284116 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.18■■□□□ 1.62
GDPD1-201ENST00000284116 NLRP1Q9C000 1473 aa25.18■■□□□ 1.62
GDPD1-201ENST00000284116 C3P01024 1663 aa25.18■■□□□ 1.62
GDPD1-201ENST00000284116 CDK19Q9BWU1 502 aa25.16■■□□□ 1.62
GDPD1-201ENST00000284116 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
GDPD1-201ENST00000284116 NSD2O96028 1365 aa25.16■■□□□ 1.62
GDPD1-201ENST00000284116 METP08581 1390 aa25.16■■□□□ 1.62
GDPD1-201ENST00000284116 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
GDPD1-201ENST00000284116 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.15■■□□□ 1.62
GDPD1-201ENST00000284116 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.14■■□□□ 1.62
GDPD1-201ENST00000284116 A0A1W2PP64 1363 aa25.14■■□□□ 1.61
GDPD1-201ENST00000284116 SIRT1Q96EB6 747 aa25.13■■□□□ 1.61
GDPD1-201ENST00000284116 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.13■■□□□ 1.61
GDPD1-201ENST00000284116 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.13■■□□□ 1.61
GDPD1-201ENST00000284116 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.12■■□□□ 1.61
GDPD1-201ENST00000284116 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.1■■□□□ 1.61
GDPD1-201ENST00000284116 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.09■■□□□ 1.61
GDPD1-201ENST00000284116 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.09■■□□□ 1.61
GDPD1-201ENST00000284116 TECPR2O15040 1411 aa25.08■■□□□ 1.61
GDPD1-201ENST00000284116 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.08■■□□□ 1.61
GDPD1-201ENST00000284116 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.07■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.07■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 LTKP29376 864 aa25.06■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.06■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 SHPRHQ149N8 1683 aa25.05■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 CPS1P31327 1500 aa25.05■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 CABP1Q9NZU7 370 aa25.05■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.04■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 MTHFSP49914 203 aa25.04■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF521Q96K83 1311 aa25.04■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.03■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 SLIT1O75093 1534 aa25.02■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 MED14O60244 1454 aa25.02■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.02■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.02■■□□□ 1.6
GDPD1-201ENST00000284116 EID1Q9Y6B2 187 aa25.01■■□□□ 1.59
GDPD1-201ENST00000284116 FYB1O15117 783 aa25■■□□□ 1.59
GDPD1-201ENST00000284116 CFAP53Q96M91 514 aa25■■□□□ 1.59
GDPD1-201ENST00000284116 ATP7BP35670 1465 aa25■■□□□ 1.59
GDPD1-201ENST00000284116 APAF1O14727 1248 aa24.99■■□□□ 1.59
GDPD1-201ENST00000284116 NGEFQ8N5V2 710 aa24.99■■□□□ 1.59
GDPD1-201ENST00000284116 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.98■■□□□ 1.59
GDPD1-201ENST00000284116 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.98■■□□□ 1.59
GDPD1-201ENST00000284116 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.98■■□□□ 1.59
GDPD1-201ENST00000284116 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
GDPD1-201ENST00000284116 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
GDPD1-201ENST00000284116 GOLGA2Q08379 1002 aa24.96■■□□□ 1.59
GDPD1-201ENST00000284116 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.95■■□□□ 1.59
GDPD1-201ENST00000284116 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.92■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.92■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 TBX22Q9Y458 520 aa24.92■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 SLFN5Q08AF3 891 aa24.91■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.91■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 RUNDC1Q96C34 613 aa24.91■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.91■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.9■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 PTPRUQ92729 1446 aa24.9■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 ADGRB2O60241 1585 aa24.9■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
GDPD1-201ENST00000284116 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.89■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.87■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 DIP2AQ14689 1571 aa24.86■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 AKAP12Q02952 1782 aa24.86■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.85■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.85■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.84■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.84■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.84■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.83■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 ITSN1Q15811 1721 aa24.83■■□□□ 1.57
GDPD1-201ENST00000284116 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.83■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.82■■□□□ 1.56
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