RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 TRPM2O94759 1503 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 NOS1P29475 1434 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 TBC1D2Q9BYX2 928 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 ABCC1P33527 1531 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 GGNBP2Q9H3C7 697 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 STAC3Q96MF2 364 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 PTPRTO14522 1441 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.52■□□□□ 0.72
PTPRH-201ENST00000263434 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 TBC1D32Q96NH3 1257 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 CEP152O94986 1710 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 MVPQ14764 893 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 SLC24A1O60721 1099 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 ABCA6Q8N139 1617 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 FANCAO15360 1455 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 WDR63Q8IWG1 891 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 NGEFQ8N5V2 710 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 C22orf23Q9BZE7 217 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 FBLN1P23142 703 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 SSH1Q8WYL5 1049 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 TRIM27P14373 513 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRH-201ENST00000263434 ADGRL1O94910 1474 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 ATP7AQ04656 1500 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 LNPKQ9C0E8 428 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 ANTXR1Q9H6X2 564 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 NINLQ9Y2I6 1382 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 PANK2Q9BZ23 570 aa19.43■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa19.43■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM57Q8N5G2 664 aa19.43■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 TET3O43151 1660 aa19.42■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 RIPK4P57078 832 aa19.42■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 C1orf115Q9H7X2 142 aa19.41■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 EVC2Q86UK5 1308 aa19.41■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 NLRP1Q9C000 1473 aa19.41■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 TMPOP42166 694 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
PTPRH-201ENST00000263434 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa19.39■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 MCM4P33991 863 aa19.39■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 SHROOM2Q13796 1616 aa19.38■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 HSCBQ8IWL3 235 aa19.38■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.38■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa19.38■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 KIF1BO60333 1816 aa19.38■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 MROH2AA6NES4 1674 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP19.36■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 DDX19BQ9UMR2 479 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 TRIM35Q9UPQ4 493 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 TRAK2O60296 914 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 MYOM2P54296 1465 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 HMOX1P09601 288 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 SHPRHQ149N8 1683 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 CHMP5Q9NZZ3 219 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC27Q2M243 656 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 ANKRD45Q5TZF3 282 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 IQSEC2Q5JU85 1478 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 RAPGEF3O95398 923 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRH-201ENST00000263434 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 AAMPQ13685 434 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 NPATQ14207 1427 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 A0A1W2PP64 1363 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 PRAM1Q96QH2 718 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 DEPDC5O75140 1603 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 QRICH2Q9H0J4 1663 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 VGFO15240 615 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 FYB1O15117 783 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 CD109Q6YHK3 1445 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 PLEKHF1Q96S99 279 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRH-201ENST00000263434 EFCAB6Q5THR3 1501 aa19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms