RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 QRICH2Q9H0J4 1663 aa13.15□□□□□ -0.3
PDCL-201ENST00000259467 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PDCL-201ENST00000259467 STK26Q9P289 416 aa13.15□□□□□ -0.3
PDCL-201ENST00000259467 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.31
PDCL-201ENST00000259467 NLRP1Q9C000 1473 aa13.14□□□□□ -0.31
PDCL-201ENST00000259467 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PDCL-201ENST00000259467 PPP2R1AP30153 589 aa13.14□□□□□ -0.31
PDCL-201ENST00000259467 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PDCL-201ENST00000259467 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.14□□□□□ -0.31
PDCL-201ENST00000259467 ZFYVE9O95405 1425 aa13.13□□□□□ -0.31
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PDCL-201ENST00000259467 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa13.12□□□□□ -0.31
PDCL-201ENST00000259467 ZNF521Q96K83 1311 aa13.12□□□□□ -0.31
PDCL-201ENST00000259467 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
PDCL-201ENST00000259467 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.12□□□□□ -0.31
PDCL-201ENST00000259467 KNSTRNQ9Y448 316 aa13.12□□□□□ -0.31
PDCL-201ENST00000259467 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PDCL-201ENST00000259467 RCAN3Q9UKA8 241 aa13.11□□□□□ -0.31
PDCL-201ENST00000259467 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PDCL-201ENST00000259467 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
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PDCL-201ENST00000259467 SHPRHQ149N8 1683 aa13.09□□□□□ -0.31
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PDCL-201ENST00000259467 METP08581 1390 aa13.08□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.07□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 CDCA7LQ96GN5 454 aa13.07□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
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PDCL-201ENST00000259467 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 CARD14Q9BXL6 1004 aa13.06□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.06□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 CCDC136Q96JN2 1154 aa13.06□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.05□□□□□ -0.32
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PDCL-201ENST00000259467 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa13.05□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 SLIT1O75093 1534 aa13.04□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa13.04□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 ALKQ9UM73 1620 aa13.04□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13.04□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 TULP4Q9NRJ4 1543 aa13.03□□□□□ -0.32
PDCL-201ENST00000259467 DUSP27Q5VZP5 1158 aa13.02□□□□□ -0.33
PDCL-201ENST00000259467 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.02□□□□□ -0.33
PDCL-201ENST00000259467 EXOC6Q8TAG9 804 aa13.02□□□□□ -0.33
PDCL-201ENST00000259467 NGEFQ8N5V2 710 aa13.01□□□□□ -0.33
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PDCL-201ENST00000259467 PTPRUQ92729 1446 aa13□□□□□ -0.33
PDCL-201ENST00000259467 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
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PDCL-201ENST00000259467 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
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PDCL-201ENST00000259467 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PDCL-201ENST00000259467 IQSEC2Q5JU85 1478 aa12.98□□□□□ -0.33
PDCL-201ENST00000259467 DEKP35659 375 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PDCL-201ENST00000259467 NUTM2FA1L443 756 aa12.97□□□□□ -0.33
PDCL-201ENST00000259467 POGKQ9P215 609 aa12.97□□□□□ -0.33
PDCL-201ENST00000259467 ROBO2Q9HCK4 1378 aa12.97□□□□□ -0.33
PDCL-201ENST00000259467 GOLGA2Q08379 1002 aa12.97□□□□□ -0.33
PDCL-201ENST00000259467 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
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PDCL-201ENST00000259467 TBX22Q9Y458 520 aa12.96□□□□□ -0.33
PDCL-201ENST00000259467 NSD2O96028 1365 aa12.96□□□□□ -0.34
PDCL-201ENST00000259467 MED14O60244 1454 aa12.96□□□□□ -0.34
PDCL-201ENST00000259467 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PDCL-201ENST00000259467 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa12.95□□□□□ -0.34
PDCL-201ENST00000259467 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
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PDCL-201ENST00000259467 NINLQ9Y2I6 1382 aa12.94□□□□□ -0.34
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PDCL-201ENST00000259467 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PDCL-201ENST00000259467 MS4A1P11836 297 aa12.94□□□□□ -0.34
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PDCL-201ENST00000259467 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PDCL-201ENST00000259467 CRBNQ96SW2 442 aa12.92□□□□□ -0.34
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PDCL-201ENST00000259467 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa12.92□□□□□ -0.34
PDCL-201ENST00000259467 EVC2Q86UK5 1308 aa12.91□□□□□ -0.34
PDCL-201ENST00000259467 ABCC11Q96J66 1382 aa12.91□□□□□ -0.34
PDCL-201ENST00000259467 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PDCL-201ENST00000259467 DLC1Q96QB1 1528 aa12.9□□□□□ -0.34
PDCL-201ENST00000259467 E9PSI1 815 aa12.9□□□□□ -0.34
PDCL-201ENST00000259467 APAF1O14727 1248 aa12.9□□□□□ -0.34
PDCL-201ENST00000259467 CD163L1Q9NR16 1453 aa12.9□□□□□ -0.34
PDCL-201ENST00000259467 C20orf194Q5TEA3 1177 aa12.89□□□□□ -0.35
PDCL-201ENST00000259467 CGNL1Q0VF96 1302 aa12.89□□□□□ -0.35
PDCL-201ENST00000259467 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PDCL-201ENST00000259467 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PDCL-201ENST00000259467 CCDC146Q8IYE0 955 aa12.88□□□□□ -0.35
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