RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253332.5

AKAP12-201, Transcript of A-kinase anchoring protein 12, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene AKAP12, Length 6,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP12-201ENST00000253332 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 CNNM1Q9NRU3 951 aa18.81■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 NLRP13Q86W25 1043 aa18.81■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 CRBNQ96SW2 442 aa18.8■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 CCER2I3L3R5 266 aa18.8■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 WDR70Q9NW82 654 aa18.8■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 PTPRGP23470 1445 aa18.79■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 GRM1Q13255 1194 aa18.79■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 MYL6BP14649 208 aa18.79■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.79■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 FMN1Q68DA7 1419 aa18.78■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa18.78■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.77■□□□□ 0.6
AKAP12-201ENST00000253332 CCDC70Q6NSX1 233 aa18.77■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 ZHX3Q9H4I2 956 aa18.77■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 PIBF1Q8WXW3 757 aa18.76■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.76■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 PDE3BQ13370 1112 aa18.76■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 SIL1Q9H173 461 aa18.76■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 HOMER1Q86YM7 354 aa18.75■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 PDILTQ8N807 584 aa18.75■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 CABP4P57796 275 aa18.74■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 TTC39AQ5SRH9 613 aa18.74■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 KRT18P05783 430 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.74■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 PKNOX2Q96KN3 472 aa18.74■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 GPRASP1Q5JY77 1395 aa18.73■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 OFD1O75665 1012 aa18.73■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 RNF20Q5VTR2 975 aa18.73■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 ADAMTS2O95450 1211 aa18.73■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 FSD1Q9BTV5 496 aa18.73■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa18.72■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 UACAQ9BZF9 1416 aa18.72■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 KIF15Q9NS87 1388 aa18.72■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 BRMS1Q9HCU9 246 aa18.72■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 LNPKQ9C0E8 428 aa18.72■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 PRDM2Q13029 1718 aa18.72■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.71■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.71■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.71■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.71■□□□□ 0.59
AKAP12-201ENST00000253332 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.71■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.7■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.7■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa18.69■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 E9PSI1 815 aa18.69■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.68■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 TATP17735 454 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 WDR78Q5VTH9 848 aa18.67■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 ERC2O15083 957 aa18.67■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.66■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 SASS6Q6UVJ0 657 aa18.65■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.65■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 NUP133Q8WUM0 1156 aa18.65■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.65■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 STK3Q13188 491 aa18.64■□□□□ 0.58
AKAP12-201ENST00000253332 REC8O95072 547 aa18.64■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 SURF6O75683 361 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 XBP1P17861 261 aa18.64■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.63■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 PDCL3Q9H2J4 239 aa18.63■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 FAM13BQ9NYF5 915 aa18.63■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.62■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 USP5P45974 858 aa18.62■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 PANK1Q8TE04 598 aa18.62■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.62■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 MPHOSPH8Q99549 860 aa18.62■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 SART3Q15020 963 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 PRDM11Q9NQV5 511 aa18.62■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 CAGE1Q8TC20 777 aa18.61■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 DDX11L8A8MPP1 907 aa18.61■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 SYCP1Q15431 976 aa18.61■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
AKAP12-201ENST00000253332 PRAM1Q96QH2 718 aa18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms