RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.2■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 MADDQ8WXG6 1647 aa23.19■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 WWC1Q8IX03 1113 aa23.19■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 RGL3Q3MIN7 710 aa23.18■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.17■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 KANK1Q14678 1352 aa23.17■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.17■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.17■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 RLBP1P12271 317 aa23.16■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.14■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CGRRF1-201ENST00000216420 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 ABCA8O94911 1581 aa23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 CEP152O94986 1710 aa23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 SHPRHQ149N8 1683 aa23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 WDR63Q8IWG1 891 aa23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.08■■□□□ 1.29
CGRRF1-201ENST00000216420 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF445P59923 1031 aa23.06■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 STAC3Q96MF2 364 aa23.06■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.06■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC27Q2M243 656 aa23.05■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 TNNQ9UQP3 1299 aa23.05■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 DYNC1I1O14576 645 aa23.05■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 PDLIM2Q96JY6 352 aa23.05■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 PREX2Q70Z35 1606 aa23.05■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.04■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.03■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 MCM5P33992 734 aa23.03■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.03■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC24A1O60721 1099 aa23.02■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.02■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 RUNDC1Q96C34 613 aa23.02■■□□□ 1.28
CGRRF1-201ENST00000216420 IFT140Q96RY7 1462 aa23.01■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM13BQ9NYF5 915 aa23■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 ATP10BO94823 1461 aa22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 UQCRHP07919 91 aa22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF2CQ99661 725 aa22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 PLEKHG5O94827 1062 aa22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1-201ENST00000216420 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.95■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.95■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF16BQ96L93 1317 aa22.95■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 ERVK-7P63135 1459 aa22.95■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 ADGRL1O94910 1474 aa22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.93■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.93■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 ADGRB2O60241 1585 aa22.93■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 REREQ9P2R6 1566 aa22.93■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 SSFA2P28290 1259 aa22.92■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 NUCB1Q02818 461 aa22.91■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.91■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.91■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 TRPM2O94759 1503 aa22.91■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.91■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.9■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 DMTNQ08495 405 aa22.9■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
CGRRF1-201ENST00000216420 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.89■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 USP32Q8NFA0 1604 aa22.89■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.89■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.88■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 RBSNQ9H1K0 784 aa22.86■■□□□ 1.25
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