RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000188376.9

SLC25A3-201, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-201ENST00000188376 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 NLRP13Q86W25 1043 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
SLC25A3-201ENST00000188376 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC25A3-201ENST00000188376 TECPR2O15040 1411 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC25A3-201ENST00000188376 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC25A3-201ENST00000188376 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC25A3-201ENST00000188376 CDK19Q9BWU1 502 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC25A3-201ENST00000188376 MED14O60244 1454 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC25A3-201ENST00000188376 CPS1P31327 1500 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC25A3-201ENST00000188376 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.02■■□□□ 1.76
SLC25A3-201ENST00000188376 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26■■□□□ 1.75
SLC25A3-201ENST00000188376 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26■■□□□ 1.75
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SLC25A3-201ENST00000188376 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SLC25A3-201ENST00000188376 PPP2R1AP30153 589 aa26■■□□□ 1.75
SLC25A3-201ENST00000188376 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.99■■□□□ 1.75
SLC25A3-201ENST00000188376 SIRT1Q96EB6 747 aa25.99■■□□□ 1.75
SLC25A3-201ENST00000188376 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.97■■□□□ 1.75
SLC25A3-201ENST00000188376 TBX22Q9Y458 520 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC25A3-201ENST00000188376 USP32Q8NFA0 1604 aa25.95■■□□□ 1.75
SLC25A3-201ENST00000188376 PTPRUQ92729 1446 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC25A3-201ENST00000188376 A0A1W2PP64 1363 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC25A3-201ENST00000188376 DIP2AQ14689 1571 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC25A3-201ENST00000188376 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SLC25A3-201ENST00000188376 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC25A3-201ENST00000188376 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.91■■□□□ 1.74
SLC25A3-201ENST00000188376 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.9■■□□□ 1.74
SLC25A3-201ENST00000188376 CABP1Q9NZU7 370 aa25.9■■□□□ 1.74
SLC25A3-201ENST00000188376 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.9■■□□□ 1.74
SLC25A3-201ENST00000188376 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.9■■□□□ 1.74
SLC25A3-201ENST00000188376 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.89■■□□□ 1.74
SLC25A3-201ENST00000188376 MORC1Q86VD1 984 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A3-201ENST00000188376 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SLC25A3-201ENST00000188376 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC25A3-201ENST00000188376 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SLC25A3-201ENST00000188376 ADGRB2O60241 1585 aa25.83■■□□□ 1.73
SLC25A3-201ENST00000188376 NSD2O96028 1365 aa25.83■■□□□ 1.73
SLC25A3-201ENST00000188376 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SLC25A3-201ENST00000188376 PTCH1Q13635 1447 aa25.83■■□□□ 1.72
SLC25A3-201ENST00000188376 ATP7BP35670 1465 aa25.82■■□□□ 1.72
SLC25A3-201ENST00000188376 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.82■■□□□ 1.72
SLC25A3-201ENST00000188376 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SLC25A3-201ENST00000188376 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SLC25A3-201ENST00000188376 PIK3R4Q99570 1358 aa25.79■■□□□ 1.72
SLC25A3-201ENST00000188376 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.79■■□□□ 1.72
SLC25A3-201ENST00000188376 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
SLC25A3-201ENST00000188376 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.78■■□□□ 1.72
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.78■■□□□ 1.72
SLC25A3-201ENST00000188376 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A3-201ENST00000188376 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A3-201ENST00000188376 KCNA6P17658 529 aa25.76■■□□□ 1.72
SLC25A3-201ENST00000188376 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.72
SLC25A3-201ENST00000188376 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SLC25A3-201ENST00000188376 FYB1O15117 783 aa25.76■■□□□ 1.71
SLC25A3-201ENST00000188376 INSRP06213 1382 aa25.76■■□□□ 1.71
SLC25A3-201ENST00000188376 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.75■■□□□ 1.71
SLC25A3-201ENST00000188376 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.74■■□□□ 1.71
SLC25A3-201ENST00000188376 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SLC25A3-201ENST00000188376 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SLC25A3-201ENST00000188376 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.74■■□□□ 1.71
SLC25A3-201ENST00000188376 NUTM2FA1L443 756 aa25.73■■□□□ 1.71
SLC25A3-201ENST00000188376 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
SLC25A3-201ENST00000188376 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SLC25A3-201ENST00000188376 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
SLC25A3-201ENST00000188376 ITSN1Q15811 1721 aa25.71■■□□□ 1.71
SLC25A3-201ENST00000188376 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.7■■□□□ 1.71
SLC25A3-201ENST00000188376 MTHFSP49914 203 aa25.7■■□□□ 1.7
SLC25A3-201ENST00000188376 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SLC25A3-201ENST00000188376 AKAP12Q02952 1782 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A3-201ENST00000188376 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A3-201ENST00000188376 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SLC25A3-201ENST00000188376 SHPRHQ149N8 1683 aa25.65■■□□□ 1.7
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
SLC25A3-201ENST00000188376 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SLC25A3-201ENST00000188376 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SLC25A3-201ENST00000188376 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SLC25A3-201ENST00000188376 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SLC25A3-201ENST00000188376 CFAP53Q96M91 514 aa25.63■■□□□ 1.69
SLC25A3-201ENST00000188376 ACEP12821 1306 aa25.62■■□□□ 1.69
SLC25A3-201ENST00000188376 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.62■■□□□ 1.69
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.61■■□□□ 1.69
SLC25A3-201ENST00000188376 NME9Q86XW9 330 aa25.61■■□□□ 1.69
SLC25A3-201ENST00000188376 NUDCQ9Y266 331 aa25.6■■□□□ 1.69
SLC25A3-201ENST00000188376 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.6■■□□□ 1.69
SLC25A3-201ENST00000188376 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
SLC25A3-201ENST00000188376 NEFLP07196 543 aa25.58■■□□□ 1.69
SLC25A3-201ENST00000188376 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.57■■□□□ 1.68
SLC25A3-201ENST00000188376 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.57■■□□□ 1.68
SLC25A3-201ENST00000188376 FKBP8Q14318 412 aa25.57■■□□□ 1.68
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