RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
SIKE1-201ENST00000060969 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SIKE1-201ENST00000060969 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SIKE1-201ENST00000060969 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.97■■□□□ 1.59
SIKE1-201ENST00000060969 METP08581 1390 aa24.96■■□□□ 1.59
SIKE1-201ENST00000060969 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SIKE1-201ENST00000060969 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.96■■□□□ 1.59
SIKE1-201ENST00000060969 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.95■■□□□ 1.59
SIKE1-201ENST00000060969 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SIKE1-201ENST00000060969 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SIKE1-201ENST00000060969 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.94■■□□□ 1.58
SIKE1-201ENST00000060969 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.93■■□□□ 1.58
SIKE1-201ENST00000060969 DLC1Q96QB1 1528 aa24.92■■□□□ 1.58
SIKE1-201ENST00000060969 NUDCQ9Y266 331 aa24.91■■□□□ 1.58
SIKE1-201ENST00000060969 NLRP1Q9C000 1473 aa24.91■■□□□ 1.58
SIKE1-201ENST00000060969 USP32Q8NFA0 1604 aa24.9■■□□□ 1.58
SIKE1-201ENST00000060969 ABCC11Q96J66 1382 aa24.9■■□□□ 1.58
SIKE1-201ENST00000060969 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SIKE1-201ENST00000060969 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SIKE1-201ENST00000060969 CDK19Q9BWU1 502 aa24.89■■□□□ 1.58
SIKE1-201ENST00000060969 A0A1W2PP64 1363 aa24.88■■□□□ 1.57
SIKE1-201ENST00000060969 LTKP29376 864 aa24.88■■□□□ 1.57
SIKE1-201ENST00000060969 INSRP06213 1382 aa24.88■■□□□ 1.57
SIKE1-201ENST00000060969 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
SIKE1-201ENST00000060969 MORC1Q86VD1 984 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-201ENST00000060969 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-201ENST00000060969 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-201ENST00000060969 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.86■■□□□ 1.57
SIKE1-201ENST00000060969 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-201ENST00000060969 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-201ENST00000060969 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-201ENST00000060969 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.81■■□□□ 1.56
SIKE1-201ENST00000060969 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.81■■□□□ 1.56
SIKE1-201ENST00000060969 CABP1Q9NZU7 370 aa24.8■■□□□ 1.56
SIKE1-201ENST00000060969 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.8■■□□□ 1.56
SIKE1-201ENST00000060969 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.79■■□□□ 1.56
SIKE1-201ENST00000060969 TECPR2O15040 1411 aa24.79■■□□□ 1.56
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.78■■□□□ 1.56
SIKE1-201ENST00000060969 CPS1P31327 1500 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-201ENST00000060969 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-201ENST00000060969 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-201ENST00000060969 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-201ENST00000060969 SLIT1O75093 1534 aa24.77■■□□□ 1.56
SIKE1-201ENST00000060969 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 NSD2O96028 1365 aa24.76■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.76■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.76■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.76■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.76■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 EID1Q9Y6B2 187 aa24.75■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 SHPRHQ149N8 1683 aa24.74■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 MTHFSP49914 203 aa24.73■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 PDE3BQ13370 1112 aa24.73■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 MED14O60244 1454 aa24.72■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 FYB1O15117 783 aa24.71■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 PTPRUQ92729 1446 aa24.71■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 SIRT1Q96EB6 747 aa24.71■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.7■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
SIKE1-201ENST00000060969 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-201ENST00000060969 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.7■■□□□ 1.54
SIKE1-201ENST00000060969 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.68■■□□□ 1.54
SIKE1-201ENST00000060969 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.68■■□□□ 1.54
SIKE1-201ENST00000060969 ATP7BP35670 1465 aa24.68■■□□□ 1.54
SIKE1-201ENST00000060969 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SIKE1-201ENST00000060969 APAF1O14727 1248 aa24.67■■□□□ 1.54
SIKE1-201ENST00000060969 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SIKE1-201ENST00000060969 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.66■■□□□ 1.54
SIKE1-201ENST00000060969 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
SIKE1-201ENST00000060969 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF521Q96K83 1311 aa24.65■■□□□ 1.54
SIKE1-201ENST00000060969 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.63■■□□□ 1.53
SIKE1-201ENST00000060969 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.63■■□□□ 1.53
SIKE1-201ENST00000060969 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.63■■□□□ 1.53
SIKE1-201ENST00000060969 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SIKE1-201ENST00000060969 CFAP53Q96M91 514 aa24.62■■□□□ 1.53
SIKE1-201ENST00000060969 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.62■■□□□ 1.53
SIKE1-201ENST00000060969 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SIKE1-201ENST00000060969 TBX22Q9Y458 520 aa24.61■■□□□ 1.53
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.6■■□□□ 1.53
SIKE1-201ENST00000060969 ADGRB2O60241 1585 aa24.6■■□□□ 1.53
SIKE1-201ENST00000060969 NUTM2FA1L443 756 aa24.59■■□□□ 1.53
SIKE1-201ENST00000060969 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.59■■□□□ 1.53
SIKE1-201ENST00000060969 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.59■■□□□ 1.53
SIKE1-201ENST00000060969 FBLN1P23142 703 aa24.57■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 GOLGA2Q08379 1002 aa24.56■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 DIP2AQ14689 1571 aa24.56■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.55■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.55■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.54■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 NME9Q86XW9 330 aa24.54■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.54■■□□□ 1.52
SIKE1-201ENST00000060969 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.54■■□□□ 1.52
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