RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 SHISA7A6NL88 538 aa23.62■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 CD19P15391 556 aa23.62■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 CTHP32929 405 aa23.62■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 SGO2Q562F6 1265 aa23.62■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 TMEM270Q6UE05 265 aa23.62■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 C1orf210Q8IVY1 113 aa23.62■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 CPQQ9Y646 472 aa23.62■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 LEFTY2O00292 366 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 OLFM2O95897 454 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 TCF3P15923 654 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 TUBP50607 506 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 SNX30Q5VWJ9 437 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 RRAGAQ7L523 313 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 LMO3Q8TAP4 145 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 CLDN23Q96B33 292 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 MED15Q96RN5 788 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 HPS4Q9NQG7 708 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 SCML2Q9UQR0 700 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 MIA3Q5JRA6 1907 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 HHLA1C9JL84 531 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 RPS9P46781 194 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 CPA6Q8N4T0 437 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD52Q8NB46 1076 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 ATP2A3Q93084 1043 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 LMAN1LQ9HAT1 526 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 HESX1Q9UBX0 185 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 KIAA1257Q9ULG3 409 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 WNT6Q9Y6F9 365 aa23.61■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa23.6■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 ARSAP15289 507 aa23.6■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 GCNT1Q02742 428 aa23.6■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 THAP9Q9H5L6 903 aa23.6■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 ECT2Q9H8V3 914 aa23.6■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 FAM86C1Q9NVL1 165 aa23.6■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 TSPAN16Q9UKR8 245 aa23.6■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 COCHO43405 550 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 LAMTOR5O43504 91 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 TLR5O60602 858 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 VDRP11473 427 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 KIF11P52732 1056 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 ZXDBP98169 803 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 NR1H3Q13133 447 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 LRRC32Q14392 662 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 TXNDC11Q6PKC3 985 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 UBR7Q8N806 425 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 EXOC4Q96A65 974 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 CCSER2Q9H7U1 834 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 PIEZO1Q92508 2521 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 CYP26A1O43174 497 aa23.58■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 PAEPP09466 180 aa23.58■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 BCAT1P54687 386 aa23.58■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 FZD5Q13467 585 aa23.58■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 PON2Q15165 354 aa23.58■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 KAT5Q92993 513 aa23.58■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 UBXN6Q9BZV1 441 aa23.58■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 COL4A2P08572 1712 aa23.58■■□□□ 1.37
SYT6-210ENST00000641643 DMDP11532 3685 aa23.58■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 NFATC1O95644 943 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 PSEN1P49768 467 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 EML3Q32P44 896 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 PIGZQ86VD9 579 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 IRF2BP1Q8IU81 584 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 ARHGEF19Q8IW93 802 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 ZNF687Q8N1G0 1237 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 KIAA1958Q8N8K9 716 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 LINC00597Q9H2U6 94 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 CFAP97Q9P2B7 532 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 CHRNB1P11230 501 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 DGKKQ5KSL6 1271 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 GBP6Q6ZN66 633 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 TTC30AQ86WT1 665 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 FAM81BQ96LP2 452 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 IER2Q9BTL4 223 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 MYO15AQ9UKN7 3530 aa23.57■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 GJA4P35212 333 aa23.56■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 BST2Q10589 180 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 TADA2BQ86TJ2 420 aa23.56■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 CHRDQ9H2X0 955 aa23.56■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 LRRC4Q9HBW1 653 aa23.56■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SYT6-210ENST00000641643 CYLDQ9NQC7 956 aa23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms