RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ANK1	P16157	1881 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEB2	O15479	319 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	KCNN4	O15554	427 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PFKM	P08237	780 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	FAF2	Q96CS3	445 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ERP27	Q96DN0	273 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	NOD2	Q9HC29	1040 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	SENP1	Q9P0U3	644 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152		A8MUI8	341 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	NPTXR	O95502	500 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PCK1	P35558	622 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PDK4	Q16654	411 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CA9	Q16790	459 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TTC30A	Q86WT1	665 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GUA9	196 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	NDC80	O14777	642 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	KRT16	P08779	473 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	NOMO1	Q15155	1222 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	RBL1	P28749	1068 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	INCA1	Q0VD86	236 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ACAP1	Q15027	740 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GRIK4	Q16099	956 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	VSIG1	Q86XK7	387 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PPTC7	Q8NI37	304 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CFAP36	Q96G28	342 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	RNF157	Q96PX1	679 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	C2CD2	Q9Y426	696 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CFAP73	A6NFT4	308 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152		E7ESA3	106 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	IL4R	P24394	825 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	BCAR1	P56945	870 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	OVGP1	Q12889	678 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PLD5	Q8N7P1	536 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CLGN	O14967	610 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	APRT	P07741	180 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PDGFRB	P09619	1106 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SDC4	P31431	198 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TFDP2	Q14188	446 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM237	Q96Q45	408 aa		13.64	□□□□□ -0.23

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