RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC142Q17RM4 750 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 CXorf38Q8TB03 319 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 HHIPQ96QV1 700 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A12Q96S37 553 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF9Q9HAQ2 790 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC8A2Q9UPR5 921 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 SOBPA7XYQ1 873 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 ATG13O75143 517 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 GJA4P35212 333 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 MPLP40238 635 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 ENPEPQ07075 957 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 TCEAL6Q6IPX3 200 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMKK1Q8N5S9 505 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 TCEAL3Q969E4 200 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 PANX2Q96RD6 677 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 PI4K2AQ9BTU6 479 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNA4P22459 653 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF12Q16514 161 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 CNGA4Q8IV77 575 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM84AQ96KN4 292 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 L1RE1Q9UN81 338 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 DCLK1O15075 740 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 NOL4O94818 638 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 DRD1P21728 446 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 BFSP1Q12934 665 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 ARID5BQ14865 1188 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF77Q15935 545 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 SLFN12LQ6IEE8 588 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 TC2NQ8N9U0 490 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1524Q8TCG1 905 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 MYRFLQ96LU7 910 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQJ5 194 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CLIC2O15247 247 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 USP4Q13107 963 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 PDGFRLQ15198 375 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 DDR2Q16832 855 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 P2RY13Q9BPV8 354 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 ECT2Q9H8V3 914 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 KCND1Q9NSA2 647 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 ANTXRLA6NF34 631 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNK5O95279 499 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CSH1P0DML2 217 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CSH2P0DML3 217 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 SKILP12757 684 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 GARTP22102 1010 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 FECHP22830 423 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP2F1P24903 491 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CCZ1BP86790 482 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 MTF1Q14872 753 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 SV2CQ496J9 727 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 SYT13Q7L8C5 426 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 OSTM1Q86WC4 334 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM186BQ8IYM0 893 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf127Q8N9H9 656 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP2S1Q96SQ9 504 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS45Q9NRW7 570 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 EBF1Q9UH73 591 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPN11Q9UMQ6 739 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 HCRTO43612 131 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 STX10O60499 249 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 GYPCP04921 128 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 EML3Q32P44 896 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO43Q4G163 708 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 NT5DC4Q86YG4 428 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCA7Q8IZY2 2146 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 OSCP1Q8WVF1 389 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 ACBD6Q9BR61 282 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCB6Q9NP58 842 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 GCNT4Q9P109 453 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 PES1O00541 588 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOC3O60645 756 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
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