RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 OLIG1Q8TAK6 271 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHO2Q8TD55 490 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 KCNK16Q96T55 309 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 SMYD3Q9H7B4 428 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D14Q9P2M4 693 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 MYOFQ9NZM1 2061 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 E2F8A0AVK6 867 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 COCHO43405 550 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 EXOC3O60645 756 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 PHACTR2O75167 634 aa26.47■■□□□ 1.83
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PTPRF-216ENST00000617451 CDH8P55286 799 aa26.47■■□□□ 1.83
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PTPRF-216ENST00000617451 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
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PTPRF-216ENST00000617451 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
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PTPRF-216ENST00000617451 C4orf47A7E2U8 309 aa26.46■■□□□ 1.83
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PTPRF-216ENST00000617451 GRIA2P42262 883 aa26.46■■□□□ 1.83
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PTPRF-216ENST00000617451 SCAMP5Q8TAC9 235 aa26.46■■□□□ 1.83
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF699Q32M78 642 aa26.45■■□□□ 1.82
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PTPRF-216ENST00000617451 HECTD3Q5T447 861 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 EMC10Q5UCC4 262 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 CYP2U1Q7Z449 544 aa26.45■■□□□ 1.82
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PTPRF-216ENST00000617451 PARD3BQ8TEW8 1205 aa26.45■■□□□ 1.82
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PTPRF-216ENST00000617451 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
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PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa26.42■■□□□ 1.82
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PTPRF-216ENST00000617451 FUKQ8N0W3 1084 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 WHAMMQ8TF30 809 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM174Q8WUU8 243 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 RLN3Q8WXF3 142 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 ELMO3Q96BJ8 720 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM9BQ9NQ34 198 aa26.42■■□□□ 1.82
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