RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	SNX17	Q15036	470 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	PTGIS	Q16647	500 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	PBK	Q96KB5	322 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	CPXM1	Q96SM3	734 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC8A1	P32418	973 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	BRCC3	P46736	316 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	SCNN1G	P51170	649 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	HIC1	Q14526	733 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	KYAT1	Q16773	422 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM187B	Q17R55	369 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC27	Q6P3X3	843 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF186	Q9NXI6	227 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CTCFL-222	ENST00000609232	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232		C9IYK1	514 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SPATA31D3	P0C874	917 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	GMPR	P36959	345 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	GJA9	P57773	515 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF677	Q86XU0	584 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	NAT14	Q8WUY8	206 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CD52	P31358	61 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CHKA	P35790	457 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	OR1G1	P47890	313 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ITGA8	P53708	1063 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF280D	Q6N043	979 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	BEST2	Q8NFU1	509 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNK16	Q96T55	309 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PLVAP	Q9BX97	442 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	HCST	Q9UBK5	93 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	NCAN	O14594	1321 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SEPT4	O43236	478 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PRPSAP2	O60256	369 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ASGR1	P07306	291 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	HOXD10	P28358	340 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SOX11	P35716	441 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CRYM	Q14894	314 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PALM2	Q8IXS6	379 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SIX4	Q9UIU6	781 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	GPR32	O75388	356 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	GAS8	O95995	478 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	AP1B1	Q10567	949 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	USP4	Q13107	963 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF135	Q8IUD6	432 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM11	Q96F44	468 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SSTR1	P30872	391 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	GRM5	P41594	1212 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77

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