RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SNX3O60493 162 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARL4CP56559 192 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DPYSL3Q14195 570 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BBS9Q3SYG4 887 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCGF5Q86SE9 256 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRABD2AQ86V40 505 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SNX27Q96L92 541 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GPR32O75388 356 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRABDQ9H4I3 376 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLXNB2O15031 1838 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CENPFP49454 3210 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDGFRBP09619 1106 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ROR1Q01973 937 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ITIH4Q14624 930 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OLFML1Q6UWY5 402 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SESTD1Q86VW0 696 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 P3H4Q92791 437 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTPN18Q99952 460 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCF3Q9NUQ8 709 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A1W2PPM1 405 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 H7C0C1 242 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP5OP48047 213 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GABBR2O75899 941 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RECQL4O94761 1208 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FOXN2P32314 431 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WDR4P57081 412 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HIC1Q14526 733 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CA9Q16790 459 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CYP2C9P11712 490 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BEST2Q8NFU1 509 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HESX1Q9UBX0 185 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A8MXQ7 604 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MGRN1O60291 552 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC130P13994 396 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADORA2BP29275 332 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NOMO1Q15155 1222 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NOTUMQ6P988 496 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HGSO14964 777 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GHRP10912 638 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SDC4P31431 198 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC8A1P32418 973 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PKDCCQ504Y2 493 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM47EQ6ZV65 393 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TTC39CQ8N584 583 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RNF157Q96PX1 679 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CPA4Q9UI42 421 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NDC80O14777 642 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ENDOD1O94919 500 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IL4RP24394 825 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms