RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605910.1

TRAM2-AS1-202, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 1,053 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TMLHEQ9NVH6 421 aa9.71□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa9.71□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CLUHO75153 1309 aa9.71□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MED7O43513 233 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LRRN2O75325 713 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RHOP08100 348 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC9A1P19634 815 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 BDNFP23560 247 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 VAMP1P23763 118 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CDC25CP30307 473 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RAD23BP54727 409 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SEC13P55735 322 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF445P59923 1031 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SGO2Q562F6 1265 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ARHGAP17Q68EM7 881 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RRAGAQ7L523 313 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF511Q8NB15 262 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 WHAMMQ8TF30 809 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GCNAQ96QF7 691 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CORO1BQ9BR76 489 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CRACR2AQ9BSW2 395 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 UBXN6Q9BZV1 441 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TSPY26PQ9H489 355 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CBX8Q9HC52 389 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PNPLA8Q9NP80 782 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CEP72Q9P209 647 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NME7Q9Y5B8 376 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FAM186AA6NE01 2351 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FAM187AA6NFU0 413 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC38A8A6NNN8 435 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LGALS16A8MUM7 142 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HCRTO43612 131 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NOL4O94818 638 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SERPINC1P01008 464 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FAM200BP0CF97 657 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PFKLP17858 780 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ATF6P18850 670 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ACO1P21399 889 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 BPIFB4P59827 614 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 UBXN1Q04323 297 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KCNMA1Q12791 1236 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 AGERQ15109 404 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MEA1Q16626 185 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DDR2Q16832 855 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF394Q53GI3 561 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TMEM270Q6UE05 265 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FAM35AQ86V20 835 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ARHGEF19Q8IW93 802 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FUKQ8N0W3 1084 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NUP93Q8N1F7 819 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 UBR7Q8N806 425 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ANKRD52Q8NB46 1076 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC2A14Q8TDB8 520 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MYRFLQ96LU7 910 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DUSP16Q9BY84 665 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HSD3B7Q9H2F3 369 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FBXO44Q9H4M3 255 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GDE1Q9NZC3 331 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EPS15L1Q9UBC2 864 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HESX1Q9UBX0 185 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DNAJC12Q9UKB3 198 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CDH7Q9ULB5 785 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CLDN5O00501 218 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TPM3P06753 285 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MYL4P12829 197 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KRT5P13647 590 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NPR3P17342 541 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PDE6CP51160 858 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TCF15Q12870 199 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CNGA2Q16280 664 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PKDCCQ504Y2 493 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PAQR9Q6ZVX9 377 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms