RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 PTPRAP18433 802 aa11.15□□□□□ -0.62
FCHO1-216ENST00000596536 RPL22P35268 128 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
FCHO1-216ENST00000596536 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
FCHO1-216ENST00000596536 LSAMPQ13449 338 aa11.15□□□□□ -0.62
FCHO1-216ENST00000596536 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
FCHO1-216ENST00000596536 IGDCC3Q8IVU1 814 aa11.15□□□□□ -0.62
FCHO1-216ENST00000596536 ARHGAP18Q8N392 663 aa11.15□□□□□ -0.62
FCHO1-216ENST00000596536 KCTD6Q8NC69 237 aa11.15□□□□□ -0.62
FCHO1-216ENST00000596536 SMC1BQ8NDV3 1235 aa11.15□□□□□ -0.62
FCHO1-216ENST00000596536 TTC17Q96AE7 1141 aa11.15□□□□□ -0.62
FCHO1-216ENST00000596536 TEX13BQ9BXU2 312 aa11.15□□□□□ -0.62
FCHO1-216ENST00000596536 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
FCHO1-216ENST00000596536 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
FCHO1-216ENST00000596536 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa11.15□□□□□ -0.62
FCHO1-216ENST00000596536 CFAP69A5D8W1 941 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 ALOX15BO15296 676 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 EDF1O60869 148 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 LRCH4O75427 683 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 CALB1P05937 261 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 ARL2P36404 184 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 VHLP40337 213 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 GJA8P48165 433 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 TNFAIP1Q13829 316 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 MORF4L2Q15014 288 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 STXBP2Q15833 593 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 UBA3Q8TBC4 463 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 SLC35B4Q969S0 331 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 VCPIP1Q96JH7 1222 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 CPXM1Q96SM3 734 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 TXLNGQ9NUQ3 528 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC166P0CW27 439 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 T-ENOLP0DO92 83 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 MOGSQ13724 837 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC6Q16204 474 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 PDK4Q16654 411 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 REPS2Q8NFH8 660 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 TSPAN18Q96SJ8 248 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 PCYT2Q99447 389 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 H0YCG3 227 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 STAT5BP51692 787 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 RTP1P59025 263 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 IGBP1P78318 339 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 CTAGE3PQ8IX95 158 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 GATA6Q92908 595 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 TTC25Q96NG3 672 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 TWNKQ96RR1 684 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 STOML1Q9UBI4 398 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 ZFP69BQ9UJL9 534 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 STARD13Q9Y3M8 1113 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.14□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 TYROBPO43914 113 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 ADCY3O60266 1144 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 SUPT3HO75486 399 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 ABHD2P08910 425 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 ZCCHC18P0CG32 403 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 CXCL8P10145 99 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 RPS12P25398 132 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 CPA2P48052 419 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 MDH1BQ5I0G3 518 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 SNX30Q5VWJ9 437 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 EEF1DP3Q658K8 133 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 RFWD3Q6PCD5 774 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 CFAP36Q96G28 342 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 FAM111AQ96PZ2 611 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 PCDH9Q9HC56 1237 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 RNF19AQ9NV58 838 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 ADGRA2Q96PE1 1338 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 RBP3P10745 1247 aa11.13□□□□□ -0.63
FCHO1-216ENST00000596536 ELK3P41970 407 aa11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms