RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	MXI1	P50539	228 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC5A3	P53794	718 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	AMPD2	Q01433	879 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	LMNB2	Q03252	620 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	WDR44	Q5JSH3	913 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	CPA6	Q8N4T0	437 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	NELL1	Q92832	810 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	SMO	Q99835	787 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	EPC1	Q9H2F5	836 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	RAB20	Q9NX57	234 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	LEFTY2	O00292	366 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	LILRB5	O75023	590 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM200B	P0CF97	657 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	PFKL	P17858	780 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCR3	P51677	355 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARHGAP8	P85298	464 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZXDB	P98169	803 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	SATB1	Q01826	763 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRRC63	Q05C16	580 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	USP4	Q13107	963 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	GAS6	Q14393	721 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPP2R5D	Q14738	602 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989		Q6ZS52	159 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	TATDN2	Q93075	761 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	RTKN	Q9BST9	563 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	IER2	Q9BTL4	223 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	NACA2	Q9H009	215 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	CPQ	Q9Y646	472 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	CILP	O75339	1184 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	GJA4	P35212	333 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	GALK1	P51570	392 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC7A9	P82251	487 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	INCA1	Q0VD86	236 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRMP	Q12912	555 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	NR1H3	Q13133	447 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	EML3	Q32P44	896 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	HECTD3	Q5T447	861 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	WHAMM	Q8TF30	809 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	NELFB	Q8WX92	580 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	COMMD8	Q9NX08	183 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	GMIP	Q9P107	970 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	USP18	Q9UMW8	372 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		13.09	□□□□□ -0.31
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	COCH	O43405	550 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	EGF	P01133	1207 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPP1R2	P41236	205 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	STX17	P56962	302 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCIN	Q13939	588 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	CAMK4	Q16566	473 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		13.08	□□□□□ -0.32
NEDD4L-233	ENST00000591989	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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