RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 RSAD2Q8WXG1 361 aa15.74■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 KIF12Q96FN5 646 aa15.74■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 FAM167AQ96KS9 214 aa15.74■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 ADPGKQ9BRR6 497 aa15.74■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 COX16Q9P0S2 106 aa15.74■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 GRID1Q9ULK0 1009 aa15.74■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 CHMP2BQ9UQN3 213 aa15.74■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 HTTP42858 3142 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 C5orf60A6NFR6 353 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 TMEM63AO94886 807 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 RPL22P35268 128 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 CDH6P55285 790 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 MYBPC3Q14896 1274 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 IGDCC3Q8IVU1 814 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 SERPINB12Q96P63 405 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 ERAP1Q9NZ08 941 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 STK38LQ9Y2H1 464 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 KDELR1P24390 212 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 ARHGAP1Q07960 439 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 MOGSQ13724 837 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 OASLQ15646 514 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 SPATA18Q8TC71 538 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 PREBQ9HCU5 417 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 GGA2Q9UJY4 613 aa15.73■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 HBP1O60381 514 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 PDGFRAP16234 1089 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 PROZP22891 400 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 GPX6P59796 221 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 RXFP2Q8WXD0 754 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 SYT15Q9BQS2 421 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 SNTG2Q9NY99 539 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 TSPAN16Q9UKR8 245 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 USP18Q9UMW8 372 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 ADCY6O43306 1168 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 NPTXRO95502 500 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 RBP3P10745 1247 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 YY1P25490 414 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 PCK1P35558 622 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 KCNJ2P63252 427 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 CA9Q16790 459 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 SPDYCQ5MJ68 293 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 MFSD5Q6N075 450 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 CGB2Q6NT52 195 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 LONP2Q86WA8 852 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 CPT1BQ92523 772 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 DPEP3Q9H4B8 488 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 GALNT8Q9NY28 637 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.72■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 SNX3O60493 162 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 B4GALT4O60513 344 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 CDH16O75309 829 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 FAM155BO75949 473 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 FGFR1P11362 822 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 CA4P22748 312 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 SLC1A5Q15758 541 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 PMF1Q6P1K2 205 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 PIGWQ7Z7B1 504 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 ANKS4BQ8N8V4 417 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 NME7Q9Y5B8 376 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 SIGLEC16A6NMB1 481 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 H3BRB1 525 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 MAN1A1P33908 653 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 GPD2P43304 727 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 OVGP1Q12889 678 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 TMEM132DQ14C87 1099 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 FBXO36Q8NEA4 188 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 OSMRQ99650 979 aa15.71■□□□□ 0.11
CTIF-205ENST00000587860 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms