RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 PLTPP55058 493 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-204ENST00000587718 GNGT1P63211 74 aa26.73■■□□□ 1.87
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CAPNS1-204ENST00000587718 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-204ENST00000587718 SEZ6Q53EL9 994 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-204ENST00000587718 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
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CAPNS1-204ENST00000587718 ADHFE1Q8IWW8 467 aa26.73■■□□□ 1.87
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CAPNS1-204ENST00000587718 AMHR2Q16671 573 aa26.72■■□□□ 1.87
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CAPNS1-204ENST00000587718 OSBPL8Q9BZF1 889 aa26.71■■□□□ 1.87
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CAPNS1-204ENST00000587718 SKIP12755 728 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf118Q5T5N4 469 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD16Q68DU8 428 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 RHBDF2Q6PJF5 856 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 SH2D3CQ8N5H7 860 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC89Q8N998 374 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 PDZD7Q9H5P4 517 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 DERAQ9Y315 318 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 B4GALT5O43286 388 aa26.67■■□□□ 1.86
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