RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581598.1

CCDC42-203, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC42, Length 538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-203ENST00000581598 ACOT1Q86TX2 421 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 TTC16Q8NEE8 873 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 FBXO32Q969P5 355 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 EML5Q05BV3 1969 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.17■■□□□ 1.14
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CCDC42-203ENST00000581598 SLC5A3P53794 718 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 INCA1Q0VD86 236 aa22.17■■□□□ 1.14
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CCDC42-203ENST00000581598 SYT13Q7L8C5 426 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.17■■□□□ 1.14
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CCDC42-203ENST00000581598 KRT13P13646 458 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 OPRD1P41143 372 aa22.16■■□□□ 1.14
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CCDC42-203ENST00000581598 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 GAB4Q2WGN9 574 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 HECTD3Q5T447 861 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.16■■□□□ 1.14
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CCDC42-203ENST00000581598 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 GAB3Q8WWW8 586 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 ACDQ96AP0 544 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 SMOQ99835 787 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 KRT82Q9NSB4 513 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 USP18Q9UMW8 372 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 E2F8A0AVK6 867 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 CYP17A1P05093 508 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 HOXC13P31276 330 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 GTF2H1P32780 548 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 PPP3CAQ08209 521 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 SPEM2Q0P670 501 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 CEP68Q76N32 757 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 OTUB2Q96DC9 234 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 LOXL4Q96JB6 756 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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CCDC42-203ENST00000581598 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC42-203ENST00000581598 COCHO43405 550 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 TRIM49P0CI25 452 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 TRIM49CP0CI26 452 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CCDC130P13994 396 aa22.14■■□□□ 1.13
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CCDC42-203ENST00000581598 GCLMP48507 274 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 DHCR24Q15392 516 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 BEST1O76090 585 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CSRP2Q16527 193 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 C12orf29Q8N999 325 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 USP33Q8TEY7 942 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 EBF1Q9UH73 591 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 K7EQS6 105 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CILPO75339 1184 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 ADH1CP00326 375 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 MAP3K7CLP57077 242 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 ORC1Q13415 861 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 DMC1Q14565 340 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 KRT39Q6A163 491 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.12■■□□□ 1.13
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