RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 TRIM66O15016 1216 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 HCRTO43612 131 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 ATP2C2O75185 946 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 PLCG1P19174 1290 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRM-210ENST00000578916 USP46P62068 366 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
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PTPRM-210ENST00000578916 C10orf76Q5T2E6 689 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRM-210ENST00000578916 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
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PTPRM-210ENST00000578916 SLITRK1Q96PX8 696 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRM-210ENST00000578916 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 CRTAC1Q9NQ79 661 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 SPHK2Q9NRA0 654 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.71□□□□□ -0.86
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