RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TLDC1Q6P9B6 456 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GIMAP7Q8NHV1 300 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MCRS1Q96EZ8 462 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLCD4Q9BRC7 762 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 E5RJQ4 531 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HCRTO43612 131 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAC1P20366 129 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FOXN2P32314 431 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ELF1P32519 619 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RGS7P49802 495 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SOWAHAQ2M3V2 549 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBXO47Q5MNV8 452 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKLE1Q8NAG6 615 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TBC1D31Q96DN5 1066 aa25.2■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PFKMP08237 780 aa25.19■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GCAP28676 217 aa25.19■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAGEA4P43358 317 aa25.19■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MTFR1Q15390 333 aa25.19■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM47CQ5HY64 1035 aa25.19■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FNIP1Q8TF40 1166 aa25.19■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LPIN3Q9BQK8 851 aa25.19■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 M0QZ92 97 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CD4P01730 458 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CTSHP09668 335 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 P3H1Q32P28 736 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCNT1Q5JUK3 1230 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR6B2Q6IFH4 312 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ASRGL1Q7L266 308 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FOXP3Q9BZS1 431 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DPEP3Q9H4B8 488 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDY2AQ9Y6F7 541 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PIRO00625 290 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KPNA6O60684 536 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IL1R2P27930 398 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDR4P57081 412 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRKCZQ05513 592 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADCY1Q08828 1119 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF43Q68DV7 783 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GLIS1Q8NBF1 620 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC77Q9BR77 488 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGEF3Q9NR81 526 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A8MXQ7 604 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPTLC1O15269 473 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TJP3O95049 919 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STILQ15468 1287 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ACCSLQ4AC99 568 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTC30AQ86WT1 665 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EBF2Q9HAK2 575 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPC25Q9HBM1 224 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCSK1NQ9UHG2 260 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 XPOTO43592 962 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LIASO43766 372 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCNE1P15382 129 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HADHQ16836 314 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC142Q17RM4 750 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TFDP3Q5H9I0 405 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POLNQ7Z5Q5 900 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WNT8BQ93098 351 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HAUS1Q96CS2 278 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF560Q96MR9 790 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KPNA7A9QM74 516 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RASA4BC9J798 803 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RASA4O43374 803 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GRAP2O75791 330 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRT16P08779 473 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDGFRBP09619 1106 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RARBP10826 455 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDKN2BP42772 138 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMED2Q15363 201 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 XKR4Q5GH76 650 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ECHDC2Q86YB7 292 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF2BQ8N4N8 673 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLHL29Q96CT2 875 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM47DPA6NHR8 397 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PMF1Q6P1K2 205 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GSTA5Q7RTV2 222 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRABD2AQ86V40 505 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCHCR1Q8TD31 782 aa25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms