RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 LMAN1LQ9HAT1 526 aa18.09■□□□□ 0.49
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CCNDBP1-211ENST00000567434 ADORA2BP29275 332 aa18.08■□□□□ 0.48
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CCNDBP1-211ENST00000567434 NR1H3Q13133 447 aa18.08■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 CUL2Q13617 745 aa18.08■□□□□ 0.48
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CCNDBP1-211ENST00000567434 TXNDC11Q6PKC3 985 aa18.08■□□□□ 0.48
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CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM176AQ96HP8 235 aa18.08■□□□□ 0.48
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa18.06■□□□□ 0.48
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PSEN1P49768 467 aa18.05■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 NRLP54845 237 aa18.05■□□□□ 0.48
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CCNDBP1-211ENST00000567434 NT5C1BQ96P26 610 aa18.05■□□□□ 0.48
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CCNDBP1-211ENST00000567434 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP18.05■□□□□ 0.48
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
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CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF11P52732 1056 aa18.04■□□□□ 0.48
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CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO43Q4G163 708 aa18.04■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC186Q7Z3E2 898 aa18.04■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD52Q8NB46 1076 aa18.04■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 NACA2Q9H009 215 aa18.04■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYLDQ9NQC7 956 aa18.04■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZSCAN32Q9NX65 697 aa18.04■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMPD4Q9NXE4 827 aa18.04■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFAP97Q9P2B7 532 aa18.04■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 FANCMQ8IYD8 2048 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 TLR5O60602 858 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 AFPP02771 609 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAEPP09466 180 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 CXCL12P48061 93 aa18.03■□□□□ 0.48
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