RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 PMF1Q6P1K2 205 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP3Q9Y6I4 520 aa22.08■■□□□ 1.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIK3R2O00459 728 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRAMEF12O95522 483 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L7P0C7H9 530 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP11B1P15538 503 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 SOX5P35711 763 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPD2P43304 727 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 TKTL1P51854 596 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 PASD1Q8IV76 773 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 NXPE3Q969Y0 559 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 ECI2O75521 394 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 GABBR2O75899 941 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT9P35527 623 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 AVPR1AP37288 418 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 STAT1P42224 750 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADIGQ0VDE8 80 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 TDGQ13569 410 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCTD13Q8WZ19 329 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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CCNDBP1-208ENST00000566515 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCANO14594 1321 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 SOBPA7XYQ1 873 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 CKMP06732 381 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 LCP1P13796 627 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 HDCP19113 662 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF38Q9H0F5 515 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 NMUR1Q9HB89 426 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 OSER1Q9NX31 292 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHGC3Q9UN70 934 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCL26Q9Y258 94 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A1W2PQH9 124 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 NARSO43776 548 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 PBX1P40424 430 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDE6CP51160 858 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 MEA1Q16626 185 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAF3Q5VWG9 929 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 VITQ6UXI7 678 aa22.05■■□□□ 1.12
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CCNDBP1-208ENST00000566515 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBSNQ9H1K0 784 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 ST7Q9NRC1 585 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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CCNDBP1-208ENST00000566515 DCXO43602 365 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBED1O96006 694 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 WEE1P30291 646 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARID5AQ03989 594 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRM2Q14416 872 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 TDP1Q9NUW8 608 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 DPYSL4O14531 572 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 HECTD3Q5T447 861 aa22.03■■□□□ 1.12
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CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 BAP1Q92560 729 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSFY1Q96LI6 401 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 NAGPAQ9UK23 515 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 COCHO43405 550 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 MMEP08473 750 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLCB2Q00722 1185 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 E2F7Q96AV8 911 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 MIS12Q9H081 205 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 LHX5Q9H2C1 402 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM170AA1A519 330 aa22.02■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 TLR5O60602 858 aa22.02■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 PFKLP17858 780 aa22.02■■□□□ 1.11
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