RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 LEFTY2O00292 366 aa22.56■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 NBL1P41271 181 aa22.56■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 IFNAR2P48551 515 aa22.56■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 TUBP50607 506 aa22.56■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.56■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 NT5C1BQ96P26 610 aa22.56■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 SCML2Q9UQR0 700 aa22.56■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 PROB1E7EW31 1015 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 COCHO43405 550 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 LAMTOR5O43504 91 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 MRE11P49959 708 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 EML3Q32P44 896 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 GBP4Q96PP9 640 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 IER2Q9BTL4 223 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 ECT2Q9H8V3 914 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 SP9P0CG40 484 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 PGFP49763 221 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 KIF11P52732 1056 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 AMPD2Q01433 879 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 MTAPQ13126 283 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 LRRC32Q14392 662 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 PON2Q15165 354 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 CPA6Q8N4T0 437 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 ATP2A3Q93084 1043 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 CHFRQ96EP1 664 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.53■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.53■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.53■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 USP3Q9Y6I4 520 aa22.53■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 CYP26A1O43174 497 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 TLR5O60602 858 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 GJA4P35212 333 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 GCNT1Q02742 428 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 CCINQ13939 588 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 SGO2Q562F6 1265 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 KAT5Q92993 513 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 CYLDQ9NQC7 956 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-218ENST00000566180 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 VDRP11473 427 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 CD19P15391 556 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 SLC8A3P57103 927 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 NR1H3Q13133 447 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 GAS6Q14393 721 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM270Q6UE05 265 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 PIGZQ86VD9 579 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 TTC30AQ86WT1 665 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 NMUR1Q9HB89 426 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 OSER1Q9NX31 292 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 OBSL1O75147 1896 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 CACNA1HO95180 2353 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 E2F8A0AVK6 867 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 NFATC1O95644 943 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 PAEPP09466 180 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 RAB41Q5JT25 222 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 RRAGAQ7L523 313 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 GPT2Q8TD30 523 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 NACA2Q9H009 215 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 DACH1Q9UI36 760 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.49■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 A0A1W2PQH9 124 aa22.49■■□□□ 1.19
RNPS1-218ENST00000566180 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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