RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 TCF3P15923 654 aa32.49■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 ZXDBP98169 803 aa32.49■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 KCNH2Q12809 1159 aa32.49■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 PON2Q15165 354 aa32.49■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 CREBRFQ8IUR6 639 aa32.49■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 MLKLQ8NB16 471 aa32.49■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 DUSP16Q9BY84 665 aa32.49■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 FAM92AA1XBS5 289 aa32.48■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 HHLA1C9JL84 531 aa32.48■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
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CMTM4-204ENST00000563952 GBP4Q96PP9 640 aa32.48■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 CCSER2Q9H7U1 834 aa32.48■■■□□ 2.79
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CMTM4-204ENST00000563952 COCHO43405 550 aa32.47■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 AFPP02771 609 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
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CMTM4-204ENST00000563952 CPA6Q8N4T0 437 aa32.47■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 ATP2A3Q93084 1043 aa32.47■■■□□ 2.79
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CMTM4-204ENST00000563952 SNX30Q5VWJ9 437 aa32.46■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
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CMTM4-204ENST00000563952 MED15Q96RN5 788 aa32.46■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 NACA2Q9H009 215 aa32.46■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 LINC00597Q9H2U6 94 aa32.46■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 CHRDQ9H2X0 955 aa32.46■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 PNPLA8Q9NP80 782 aa32.46■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 CFAP97Q9P2B7 532 aa32.46■■■□□ 2.79
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CMTM4-204ENST00000563952 NBL1P41271 181 aa32.45■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 PGFP49763 221 aa32.45■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 EML3Q32P44 896 aa32.45■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 ARHGAP17Q68EM7 881 aa32.45■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 LMO3Q8TAP4 145 aa32.45■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
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CMTM4-204ENST00000563952 ECT2Q9H8V3 914 aa32.45■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 SCML2Q9UQR0 700 aa32.45■■■□□ 2.79
CMTM4-204ENST00000563952 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa32.45■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 CD19P15391 556 aa32.44■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 UBR7Q8N806 425 aa32.44■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 EHBP1Q8NDI1 1231 aa32.44■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 TUBP50607 506 aa32.43■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 AMPD2Q01433 879 aa32.43■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
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CMTM4-204ENST00000563952 DPCR1Q3MIW9 517 aa32.43■■■□□ 2.78
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CMTM4-204ENST00000563952 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa32.43■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 GJA4P35212 333 aa32.42■■■□□ 2.78
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CMTM4-204ENST00000563952 DGKKQ5KSL6 1271 aa32.42■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 TMEM270Q6UE05 265 aa32.42■■■□□ 2.78
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CMTM4-204ENST00000563952 CHFRQ96EP1 664 aa32.42■■■□□ 2.78
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CMTM4-204ENST00000563952 TLR5O60602 858 aa32.41■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 SLC8A3P57103 927 aa32.41■■■□□ 2.78
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CMTM4-204ENST00000563952 TSPAN16Q9UKR8 245 aa32.41■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 R4GN57 208 aa32.41■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 A0A1W2PQH9 124 aa32.4■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 NFATC1O95644 943 aa32.4■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP32.4■■■□□ 2.78
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CMTM4-204ENST00000563952 Q6ZS52 159 aa32.4■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 TTC30AQ86WT1 665 aa32.4■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
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CMTM4-204ENST00000563952 OSER1Q9NX31 292 aa32.4■■■□□ 2.78
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CMTM4-204ENST00000563952 PROB1E7EW31 1015 aa32.39■■■□□ 2.78
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CMTM4-204ENST00000563952 VDRP11473 427 aa32.39■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 CCINQ13939 588 aa32.39■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 PIGZQ86VD9 579 aa32.39■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 DACH1Q9UI36 760 aa32.39■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 NAGPAQ9UK23 515 aa32.39■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa32.39■■■□□ 2.78
CMTM4-204ENST00000563952 GOLGA6L22H0YM25 854 aa32.38■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
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