RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-208ENST00000563857 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 SETSIPP0DME0 302 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ACO1P21399 889 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 CACNA2D1P54289 1103 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 USP4Q13107 963 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF77Q15935 545 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 MAN2A1Q16706 1144 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 IER5LQ5T953 404 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 KLHDC10Q6PID8 442 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ZMIZ2Q8NF64 920 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 SCAMP5Q8TAC9 235 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 CYP2S1Q96SQ9 504 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 DENND4CQ5VZ89 1909 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 LEFTY2O00292 366 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 LAMTOR5O43504 91 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 MED7O43513 233 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 KIF11P52732 1056 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 BST2Q10589 180 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 TMEM270Q6UE05 265 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC186Q7Z3E2 898 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 GPIHBP1Q8IV16 184 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 C1orf210Q8IVY1 113 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 PRSS33Q8NF86 280 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 FOXQ1Q9C009 403 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 LRRC4Q9HBW1 653 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 CLIC5Q9NZA1 410 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 FBXO4Q9UKT5 387 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 CCL26Q9Y258 94 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 GREB1Q4ZG55 1949 aa16.94■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 LRRN2O75325 713 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 DCNP07585 359 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 CTHP32929 405 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 NHLH1Q02575 133 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ANGPT1Q15389 498 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 CNGA2Q16280 664 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 MEA1Q16626 185 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 FBXO43Q4G163 708 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 LMO3Q8TAP4 145 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 LRRC3BQ96PB8 259 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ARID3AQ99856 593 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 LMAN1LQ9HAT1 526 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 TMEM30AQ9NV96 361 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 GTSE1Q9NYZ3 720 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 GMIPQ9P107 970 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 CPQQ9Y646 472 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 KMT2EQ8IZD2 1858 aa16.93■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 MYH10P35580 1976 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 TLR5O60602 858 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ATG13O75143 517 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 BEST1O76090 585 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 DRD1P21728 446 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 TARSP26639 723 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 PLA2G4AP47712 749 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 NRLP54845 237 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 TCF15Q12870 199 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF528Q3MIS6 628 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 DPCR1Q3MIW9 517 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 UBR7Q8N806 425 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ZFYVE19Q96K21 471 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 CHRDQ9H2X0 955 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 EBF3Q9H4W6 596 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ECT2Q9H8V3 914 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 CYLDQ9NQC7 956 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 TSPAN16Q9UKR8 245 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 STRIP2Q9ULQ0 834 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF510Q9Y2H8 683 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 USP3Q9Y6I4 520 aa16.92■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 MUC6Q6W4X9 2439 aa16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms