RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-206ENST00000554292 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 PLCB1Q9NQ66 1216 aa29.97■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 LRRC10BA6NIK2 292 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 M0QYV0 167 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 CHADO15335 359 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 TPM4P67936 248 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 PLCB2Q00722 1185 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 PDE4CQ08493 712 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 HECTD3Q5T447 861 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 GPIHBP1Q8IV16 184 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 PBXIP1Q96AQ6 731 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 HSD3B7Q9H2F3 369 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 MFSD1Q9H3U5 465 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 ARHGEF3Q9NR81 526 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa29.96■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 OAS1P00973 400 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa29.95■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 GNA15P30679 374 aa29.95■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 PLA2G4AP47712 749 aa29.95■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 MEA1Q16626 185 aa29.95■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 CCDC186Q7Z3E2 898 aa29.95■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 SIX5Q8N196 739 aa29.95■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 LRRC4Q9HBW1 653 aa29.95■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 TRPV5Q9NQA5 729 aa29.95■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa29.95■■■□□ 2.39
PCNX1-206ENST00000554292 OLFM2O95897 454 aa29.94■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 PSEN1P49768 467 aa29.94■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 RAPGEF1Q13905 1077 aa29.94■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 PKDCCQ504Y2 493 aa29.94■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 UBA3Q8TBC4 463 aa29.94■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 SHDQ96IW2 340 aa29.94■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 SLC22A12Q96S37 553 aa29.94■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 CYP2S1Q96SQ9 504 aa29.94■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 LRFN3Q9BTN0 628 aa29.94■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 CA14Q9ULX7 337 aa29.94■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 CCL26Q9Y258 94 aa29.94■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 USP3Q9Y6I4 520 aa29.94■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 CYP26A1O43174 497 aa29.93■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 THAP12O43422 761 aa29.93■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 UCHL3P15374 230 aa29.93■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 TCF3P15923 654 aa29.93■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 SLC7A9P82251 487 aa29.93■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 NFKBIBQ15653 356 aa29.93■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 RAB41Q5JT25 222 aa29.93■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 ARHGAP18Q8N392 663 aa29.93■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 FHOD1Q9Y613 1164 aa29.93■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa29.93■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 ATP1A3P13637 1013 aa29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 BPIFB4P59827 614 aa29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 UBXN1Q04323 297 aa29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 PTK2Q05397 1052 aa29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 USP4Q13107 963 aa29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 IQCB1Q15051 598 aa29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 HFE2Q6ZVN8 426 aa29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 FBXL6Q8N531 539 aa29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 KCTD13Q8WZ19 329 aa29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 ZSWIM1Q9BR11 485 aa29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 NACA2Q9H009 215 aa29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 TKTL1P51854 596 aa29.91■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 PRKCQQ04759 706 aa29.91■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 FILIP1LQ4L180 1135 aa29.91■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 TADA2BQ86TJ2 420 aa29.91■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 ZNF606Q8WXB4 792 aa29.91■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 LRRC3BQ96PB8 259 aa29.91■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 CBX8Q9HC52 389 aa29.91■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 COL4A2P08572 1712 aa29.91■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 TLR5O60602 858 aa29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 MTF1Q14872 753 aa29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 SYCP1Q15431 976 aa29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 ZNF77Q15935 545 aa29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 SLC44A4Q53GD3 710 aa29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 FAM71AQ8IYT1 594 aa29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 SH3RF2Q8TEC5 729 aa29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 SLC35F5Q8WV83 523 aa29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 HSFY1Q96LI6 401 aa29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 ERGIC2Q96RQ1 377 aa29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 STK33Q9BYT3 514 aa29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 RNF38Q9H0F5 515 aa29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 CYLDQ9NQC7 956 aa29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 NAGPAQ9UK23 515 aa29.9■■■□□ 2.38
PCNX1-206ENST00000554292 SIK3Q9Y2K2 1263 aa29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.4 ms