RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		12.37	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		12.37	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	SGSM3	Q96HU1	749 aa		12.37	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	HSFY1	Q96LI6	401 aa		12.37	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		12.37	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	12.37	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CHST7	Q9NS84	486 aa		12.37	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		12.37	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CNTN3	Q9P232	1028 aa		12.37	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	MYO1C	O00159	1063 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CAND2	O75155	1236 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	FGB	P02675	491 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	GSTA2	P09210	222 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	ALAD	P13716	330 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNE1	P15382	129 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	GPD1	P21695	349 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	KDELR1	P24390	212 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNJ1	P48048	391 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CCT5	P48643	541 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	NR2C2	P49116	596 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP1A2	P50993	1020 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	ITIH4	Q14624	930 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	XKR4	Q5GH76	650 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	AADACL2	Q6P093	401 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	TFAP2B	Q92481	460 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	TNIP3	Q96KP6	325 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	IL23A	Q9NPF7	189 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	UST	Q9Y2C2	406 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRD1	A4D1F6	860 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442		F8VP50	259 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	MCF2L	O15068	1137 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	MDM4	O15151	490 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	PRPSAP2	O60256	369 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	LRCH4	O75427	683 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	MICAL2	O94851	1124 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	NFIC	P08651	508 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	GHR	P10912	638 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	TGM2	P21980	687 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	MAGEA4	P43358	317 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	PTPN9	P43378	593 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	ACLY	P53396	1101 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	AIF1	P55008	147 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	ARL4C	P56559	192 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	GUCY1A3	Q02108	690 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	XRCC4	Q13426	336 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	KCTD6	Q8NC69	237 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	COPS5	Q92905	334 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRC39	Q96DD0	335 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442		M0QYV0	167 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43

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