RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550261.5

PPP1CC-205, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 5

Gene PPP1CC, Length 747 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-205	ENST00000550261	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	SCN4A	P35499	1836 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	CLRN2	A0PK11	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF213	O14771	459 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF185	O15231	689 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	FGA	P02671	866 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	AMY1A	P04745	511 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	LAG3	P18627	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	FPR1	P21462	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	PCSK1	P29120	753 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	NOV	P48745	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	TDO2	P48775	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	CHN2	P52757	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	HMGA2	P52926	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	RCAN1	P53805	252 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	SLC16A1	P53985	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	HUNK	P57058	714 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	ANAPC15	P60006	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	RAP2B	P61225	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRDN	Q13061	729 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	PPIL2	Q13356	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	MTM1	Q13496	603 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	CST9	Q5W186	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	KRT23	Q9C075	422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	CNTNAP1	P78357	1384 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	SPEF2	Q9C093	1822 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	CHD4	Q14839	1912 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	COL4A1	P02462	1669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	TNKS	O95271	1327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	PLA2G6	O60733	806 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	NCR1	O76036	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	POMC	P01189	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	CETP	P11597	493 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	CAPN2	P17655	700 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	DDC	P20711	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	MCC	P23508	829 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	PSMA5	P28066	241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	TM4SF4	P48230	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	DPT	Q07507	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRAF1	Q13077	416 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	ESR2	Q92731	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	NEU1	Q99519	415 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP1CC-205	ENST00000550261	PRRX2	Q99811	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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