RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546480.1

VENTXP3-201, Transcript of VENT homeobox pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene VENTXP3, Length 773 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VENTXP3-201ENST00000546480 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.53□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.53□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.53□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 CPQQ9Y646 472 aa14.53□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 BECN2A8MW95 431 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 HHLA1C9JL84 531 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 THAP12O43422 761 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 IRF1P10914 325 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 CD72P21854 359 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 WEE1P30291 646 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 GNA15P30679 374 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 IFNAR2P48551 515 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 PLCB2Q00722 1185 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 PRKCQQ04759 706 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 PDE4CQ08493 712 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 KRT31Q15323 416 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 STILQ15468 1287 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 PIGZQ86VD9 579 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 FOXQ1Q9C009 403 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 NAGPAQ9UK23 515 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.52□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 NCOR1O75376 2440 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 A0A1W2PQH9 124 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 SMTNL1A8MU46 457 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 LEFTY2O00292 366 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 TULP2O00295 520 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 O00370 1275 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 PIK3R2O00459 728 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 MED7O43513 233 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 SETSIPP0DME0 302 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 LCP1P13796 627 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 RGS7P49802 495 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 TKTL1P51854 596 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 TNK2Q07912 1038 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 TFAP2BQ92481 460 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 RNF38Q9H0F5 515 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 EBF3Q9H4W6 596 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 GKN1Q9NS71 199 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 SCML2Q9UQR0 700 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 TRIOO75962 3097 aa14.51□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 TECTAO75443 2155 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 KANSL1LA0AUZ9 987 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 COCHO43405 550 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 TLR5O60602 858 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 RALAP11233 206 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 RARGP13631 454 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 PFKLP17858 780 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 AOC1P19801 751 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 AVPR2P30518 371 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 SOX9P48436 509 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 KIF11P52732 1056 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 ADIGQ0VDE8 80 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 USP4Q13107 963 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 ZNF77Q15935 545 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 FAM3CQ92520 227 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 ST7Q9NRC1 585 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 NUDT5Q9UKK9 219 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 COL4A2P08572 1712 aa14.49□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 MAN2B1O00754 1011 aa14.49□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 PI15O43692 258 aa14.49□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 ZNF165P49910 485 aa14.49□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 CLCN5P51795 746 aa14.49□□□□□ -0.09
VENTXP3-201ENST00000546480 ZNF132P52740 706 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms