RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545264.1

CCDC82-208, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC82, Length 557 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-208ENST00000545264 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.65□□□□□ -1.5
CCDC82-208ENST00000545264 PLAG1Q6DJT9 500 aa5.65□□□□□ -1.5
CCDC82-208ENST00000545264 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.65□□□□□ -1.5
CCDC82-208ENST00000545264 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCDC82-208ENST00000545264 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa5.65□□□□□ -1.5
CCDC82-208ENST00000545264 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCDC82-208ENST00000545264 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CCDC82-208ENST00000545264 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CCDC82-208ENST00000545264 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.65□□□□□ -1.5
CCDC82-208ENST00000545264 SARGQ9BW04 601 aa5.65□□□□□ -1.5
CCDC82-208ENST00000545264 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CCDC82-208ENST00000545264 DKK4Q9UBT3 224 aa5.65□□□□□ -1.5
CCDC82-208ENST00000545264 FAM50BQ9Y247 325 aa5.65□□□□□ -1.5
CCDC82-208ENST00000545264 WIPF3A6NGB9 483 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 SMIM22K7EJ46 135 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 M0R3H8 397 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 PMPCBO75439 489 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 IL18RAPO95256 599 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 PDE8BO95263 885 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 TIRAPP58753 221 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 TFF2Q03403 129 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.513e-7■□□□□ 11
CCDC82-208ENST00000545264 PROSER3Q2NL68 480 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 RNF44Q7L0R7 432 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 CYP2W1Q8TAV3 490 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 DPF1Q92782 380 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 IQCDQ96DY2 449 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 AMFRQ9UKV5 643 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 PCSK5Q92824 1860 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 CES2O00748 559 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 THAP12O43422 761 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 EXOC3O60645 756 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 TRIM27P14373 513 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 FPR3P25089 353 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 PIK3CBP42338 1070 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 GATMP50440 423 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 MZT2AQ6P582 158 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 TERB1Q8NA31 727 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 CIPCQ9C0C6 399 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 CAPN11Q9UMQ6 739 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 H7C1Q1 480 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 KPNA5O15131 536 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 A1BGP04217 495 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 SLC5A1P13866 664 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 ZNF543Q08ER8 600 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 GRM1Q13255 1194 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 KCNAB1Q14722 419 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 DENND2CQ68D51 928 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 SNX18Q96RF0 628 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.62□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 POM121BA6NF01 834 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 AGPSO00116 658 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 APAF1O14727 1248 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 PMM2O15305 246 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 SNX2O60749 519 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 FGAP02671 866 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 CREB1P16220 341 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 GNALP38405 381 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 RENBPP51606 427 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 CASP5P51878 434 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 TUBA4AP68366 448 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 PSG6Q00889 435 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 FOXF2Q12947 444 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 LIX1LQ8IVB5 337 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 ATP11CQ8NB49 1132 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 DDB2Q92466 427 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 MMS19Q96T76 1030 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 SNX15Q9NRS6 342 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 FLRT1Q9NZU1 646 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 RIMKLBQ9ULI2 386 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 HPSEQ9Y251 543 aa5.61□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 TISP43B9A030 160 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 EXOC5O00471 708 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC82-208ENST00000545264 SPRY2O43597 315 aa5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms