RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC130P13994 396 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 KRT20P35900 424 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NDST1P52848 882 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FAR2Q96K12 515 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GAD1Q99259 594 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 OSBPL8Q9BZF1 889 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NDEL1Q9GZM8 345 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CISHQ9NSE2 258 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NMRK1Q9NWW6 199 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 AP4E1Q9UPM8 1137 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 UBXN8O00124 270 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 BDNFP23560 247 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CD52P31358 61 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TGM3Q08188 693 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PDK2Q15119 407 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RETSATQ6NUM9 610 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM65Q6PJ69 517 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TLE6Q9H808 572 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 THEGQ9P2T0 379 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ESRRGP62508 458 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NT5DC3Q86UY8 548 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 KAT2BQ92831 832 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SLC5A5Q92911 643 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MS4A14Q96JA4 679 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SERPINB11Q96P15 392 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 IL17RBQ9NRM6 502 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 AMACRQ9UHK6 382 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 REREQ9P2R6 1566 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PPM1AP35813 382 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ARFIP2P53365 341 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MTSS1LQ765P7 747 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 LPPQ93052 612 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NRBF2Q96F24 287 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SERAC1Q96JX3 654 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SYCE1LA8MT33 242 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GYG2O15488 501 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM253P0C7T8 217 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GUCY2CP25092 1073 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CENPCQ03188 943 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SPACA7Q96KW9 195 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 BTBD19C9JJ37 291 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PSTPIP1O43586 416 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D12O60347 775 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MICAL2O94851 1124 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MED21Q13503 144 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 STAT4Q14765 748 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RGS9BPQ6ZS82 235 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FAM131BQ86XD5 332 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NUP93Q8N1F7 819 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TMC2Q8TDI7 906 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GNRH1P01148 92 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PTPN3P26045 913 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 THOP1P52888 689 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CDC16Q13042 620 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CUL3Q13618 768 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CASP8Q14790 479 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GRAMD1BQ3KR37 738 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SYTL2Q9HCH5 934 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RNF19AQ9NV58 838 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NDE1Q9NXR1 346 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ADGRB2O60241 1585 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM150BA6NC51 233 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FOXP2O15409 715 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RECQL4O94761 1208 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms