RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531920.6

MED17-208, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 3

Gene MED17, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-208	ENST00000531920	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	OR2W5	A6NFC9	320 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	TOR1B	O14657	336 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	B4GALT3	O60512	393 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	MFAP3L	O75121	409 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	TAF5L	O75529	589 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	GCSH	P23434	173 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	MGAT1	P26572	445 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CASP6	P55212	293 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	MC2R	Q01718	297 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	GRM7	Q14831	915 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	MFSD5	Q6N075	450 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ST8SIA4	Q92187	359 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	RSC1A1	Q92681	617 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	NEU1	Q99519	415 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	GPR20	Q99678	358 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	NOD2	Q9HC29	1040 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	POLG2	Q9UHN1	485 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920		A0A1W2PPH5	198 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	KIF28P	B7ZC32	967 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	AGPS	O00116	658 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ITGAL	P20701	1170 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ADORA2A	P29274	412 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	SERPINA4	P29622	427 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	KCNC1	P48547	511 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	PGD	P52209	483 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	VAMP2	P63027	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CAP1	Q01518	475 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	PDCL	Q13371	301 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FHL3	Q13643	280 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	KRT32	Q14532	448 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	GALNTL6	Q49A17	601 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	TTC22	Q5TAA0	569 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	BBS12	Q6ZW61	710 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FAM124A	Q86V42	546 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	TTC30A	Q86WT1	665 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	TSPYL6	Q8N831	410 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	HMGB4	Q8WW32	186 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CPT1B	Q92523	772 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	ERP27	Q96DN0	273 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	OR14A2	Q96R54	314 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	LMF1	Q96S06	567 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	REEP2	Q9BRK0	252 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CENPO	Q9BU64	300 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	TRIM5	Q9C035	493 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	USP22	Q9UPT9	525 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	DERA	Q9Y315	318 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	LEFTY2	O00292	366 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	STX16	O14662	325 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	DHH	O43323	396 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	SUN1	O94901	812 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	CER1	O95813	267 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	HSD11B2	P80365	405 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MED17-208	ENST00000531920	NHLH2	Q02577	135 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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