RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	RNF38	Q9H0F5	515 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	TENM4	Q6N022	2769 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691		A0A1W2PQF6	199 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	MEI4	A8MW99	385 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRIM66	O15016	1216 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	FLRT2	O43155	660 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	TULP3	O75386	442 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLA2G2A	P14555	144 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	NDUFV2	P19404	249 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	MATK	P42679	507 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	WAS	P42768	502 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	POSTN	Q15063	836 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARSH	Q5FYA8	562 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM171B	Q6P995	826 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	NAT16	Q8N8M0	369 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	REEP2	Q9BRK0	252 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	GAREM1	Q9H706	876 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	PTPRD	P23468	1912 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	SCN1A	P35498	2009 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	TSC2	P49815	1807 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	OLFM2	O95897	454 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	ITGB3	P05106	788 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	BDNF	P23560	247 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	MAOB	P27338	520 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	CD6	P30203	668 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	RBP5	P82980	135 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	GTF2B	Q00403	316 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	CYP27A1	Q02318	531 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	IL17A	Q16552	155 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	ANO4	Q32M45	955 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	GPBP1	Q86WP2	473 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	TERB1	Q8NA31	727 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	SYT15	Q9BQS2	421 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	CDH9	Q9ULB4	789 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	GABRD	O14764	452 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	CILP	O75339	1184 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRT19	P08727	400 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	HLA-E	P13747	358 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLCG1	P19174	1290 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF131	P52739	623 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	USP46	P62068	366 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	TAF10	Q12962	218 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYO1E	Q12965	1108 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	HLA-B	Q31612	363 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	DPH6	Q7L8W6	267 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TXNRD1-223	ENST00000531691	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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