RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 DNASE1L2Q92874 299 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 LRFN3Q9BTN0 628 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 BRD9Q9H8M2 597 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 SCML2Q9UQR0 700 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 COL4A3Q01955 1670 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 LGALS16A8MUM7 142 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CALCAP01258 141 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP1A3P13637 1013 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 RFX1P22670 979 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 PLA2G4AP47712 749 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 TUBP50607 506 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 IQCB1Q15051 598 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 RAB41Q5JT25 222 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 YAF2Q8IY57 180 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 UBA3Q8TBC4 463 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 IRF7Q92985 503 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CA14Q9ULX7 337 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 FHOD1Q9Y613 1164 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 USP3Q9Y6I4 520 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 KRBA1A5PL33 1030 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 M0QYV0 167 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 TULP2O00295 520 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF263O14978 683 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CHADO15335 359 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP26A1O43174 497 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 TCF3P15923 654 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 USP8P40818 1118 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 USP4Q13107 963 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 NFKBIBQ15653 356 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 SIX5Q8N196 739 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 RIN3Q8TB24 985 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF38Q9H0F5 515 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ARNTLO00327 626 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 UCHL3P15374 230 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 GNA15P30679 374 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC7A9P82251 487 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF77Q15935 545 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 HECTD3Q5T447 861 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 F5P12259 2224 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 THAP12O43422 761 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 MED7O43513 233 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CAVIN2O95810 425 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 PGFP49763 221 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 PSEN1P49768 467 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 KLK7P49862 253 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 TKTL1P51854 596 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 PLCB2Q00722 1185 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 MEA1Q16626 185 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 IER5LQ5T953 404 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXL6Q8N531 539 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 GANQ9H2C0 597 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 NMUR1Q9HB89 426 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CBX8Q9HC52 389 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ACP6Q9NPH0 428 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1W2PQH9 124 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 COCHO43405 550 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 ZXDBP98169 803 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 UBXN1Q04323 297 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 PRKCQQ04759 706 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 ADIGQ0VDE8 80 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 MTF1Q14872 753 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 SYCP1Q15431 976 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.01■□□□□ 0.79
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