RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518916.5

MSC-AS1-204, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 864 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-204ENST00000518916 HHLA1C9JL84 531 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ADAM12O43184 909 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 HSF2BPO75031 334 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PROSCO94903 275 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GJB6O95452 261 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZBED1O96006 694 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ADH1AP07327 375 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PSMA2P25787 234 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ELF1P32519 619 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 MAN1A1P33908 653 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SLC1A1P43005 524 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TUFMP49411 452 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SLC5A3P53794 718 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ADCY1Q08828 1119 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 RAB33AQ14088 237 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SLFN11Q7Z7L1 901 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 FNIP1Q8TF40 1166 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 IRGQQ8WZA9 623 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 BTBD6Q96KE9 485 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GOLPH3Q9H4A6 298 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TLR9Q9NR96 1032 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ASNSD1Q9NWL6 643 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 MAFFQ9ULX9 164 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 MYO16Q9Y6X6 1858 aa15.48■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 EYSQ5T1H1 3165 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PRRG1O14668 218 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ENC1O14682 589 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 DAB1O75553 588 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GABBR2O75899 941 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 CXCL14O95715 111 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GLI1P08151 1106 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GPD1P21695 349 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 DAOAP59103 153 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ERVK-21P61565 698 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 DUSP4Q13115 394 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 RPS6KA1Q15418 735 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 MEI1Q5TIA1 1274 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLPP4Q5VZY2 271 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ARCQ7LC44 396 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 NUP93Q8N1F7 819 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SCML4Q8N228 414 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TTC9BQ8N6N2 239 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 UBL4BQ8N7F7 174 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZNF461Q8TAF7 563 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 POF1BQ8WVV4 589 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SPATA17Q96L03 361 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 CEP295NLQ96MC4 621 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRIM7Q9C029 511 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 RXFP1Q9HBX9 757 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 HYOU1Q9Y4L1 999 aa15.47■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 DPYSL4O14531 572 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TEX28O15482 410 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GRAP2O75791 330 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 RNF8O76064 485 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 URI1O94763 535 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ABLIM3O94929 683 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 USP17L7P0C7H9 530 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ATF2P15336 505 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 COMTP21964 271 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SDC4P31431 198 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SSR1P43307 286 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TUBB2AQ13885 445 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 GRIN2CQ14957 1233 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 VEPH1Q14D04 833 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 ACAP1Q15027 740 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PTPROQ16827 1216 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 DDR2Q16832 855 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PPP2R2DQ66LE6 453 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 NT5DC3Q86UY8 548 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 EMC1Q8N766 993 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 NIPA2Q8N8Q9 360 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 SPPL3Q8TCT6 385 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 CLEC4CQ8WTT0 213 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 NCAPGQ9BPX3 1015 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 CNPY3Q9BT09 278 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TUBB2BQ9BVA1 445 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 CYP4F11Q9HBI6 524 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 EHD2Q9NZN4 543 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 TMEM59LQ9UK28 342 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.46■□□□□ 0.07
MSC-AS1-204ENST00000518916 USTQ9Y2C2 406 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms