RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516637.1

RNU6-405P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 405, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-405P, Length 110 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-405P-201ENST00000516637 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 INSCQ1MX18 579 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 CCDC17Q96LX7 622 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 TRIM5Q9C035 493 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 L1RE1Q9UN81 338 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 USP22Q9UPT9 525 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 BTBD19C9JJ37 291 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 TMEM232C9JQI7 657 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 PROB1E7EW31 1015 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 RGS10O43665 173 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 RASSF9O75901 435 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 SCGB1D2O95969 90 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 KLRC1P26715 233 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 EPHA3P29320 983 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 UQCRC1P31930 480 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 ITGA8P53708 1063 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 AWAT1Q58HT5 328 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 CTHRC1Q96CG8 243 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 FAM118BQ9BPY3 351 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 STK31Q9BXU1 1019 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 A6NNZ2 444 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 M0R3H8 397 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 FCHO1O14526 889 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 DSCR3O14972 297 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 CCP110O43303 1012 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 SPRY2O43597 315 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 RRP9O43818 475 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 MT-CO3P00414 261 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 HGFP14210 728 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 NR4A2P43354 598 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 DIO1P49895 249 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 MTHFSP49914 203 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 COPB1P53618 953 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 TIRAPP58753 221 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 MAPK7Q13164 816 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 MINDY4Q4G0A6 757 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 CHPFQ8IZ52 775 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 TPCN1Q9ULQ1 816 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 ISM1B1AKI9 464 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 FRS3O43559 492 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 PIAS2O75928 621 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 A1BGP04217 495 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 CREB1P16220 341 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 ARHGEF7Q14155 803 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 CNGA2Q16280 664 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 PLEKHG6Q3KR16 790 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 WDYHV1Q96HA8 205 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 SNX15Q9NRS6 342 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 AGPSO00116 658 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 RAB27BO00194 218 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 EXOC5O00471 708 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 ADAM10O14672 748 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 PHKG2P15735 406 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 CCT4P50991 539 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 PLCD1P51178 756 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 PGDP52209 483 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 FMO1Q01740 532 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 PPP2R5AQ15172 486 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 NPY5RQ15761 445 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF750Q32MQ0 723 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 DENND2CQ68D51 928 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-405P-201ENST00000516637 AWAT2Q6E213 333 aa4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms