RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514402.1

MATR3-223, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-223	ENST00000514402	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	SEMA5A	Q13591	1074 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	NPY5R	Q15761	445 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	SNX15	Q9NRS6	342 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	SMIM22	K7EJ46	135 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	PPP6C	O00743	305 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	RGS10	O43665	173 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	PIAS2	O75928	621 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	RASAL1	O95294	804 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	FGA	P02671	866 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	CD19	P15391	556 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	SESTD1	Q86VW0	696 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	CHSY1	Q86X52	802 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	KRT78	Q8N1N4	520 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	DDB2	Q92466	427 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	STK31	Q9BXU1	1019 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	CIPC	Q9C0C6	399 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	CHST8	Q9H2A9	424 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402		H7C4K7	107 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	AP4M1	O00189	453 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	TMPRSS11D	O60235	418 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	PRR35	P0CG20	571 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	IL1R1	P14778	569 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	TPH1	P17752	444 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	ATF3	P18847	181 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	KEL	P23276	732 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	IL1R2	P27930	398 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	RENBP	P51606	427 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	MORN5	Q5VZ52	161 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	FCRL6	Q6DN72	434 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	GALNT16	Q8N428	558 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	RITA1	Q96K30	269 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	DKK4	Q9UBT3	224 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	MID2	Q9UJV3	735 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402		A8MVJ9	347 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	CES2	O00748	559 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	EXOC3	O60645	756 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	VNN1	O95497	513 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	PGD	P52209	483 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	CLCA4	Q14CN2	919 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	ST3GAL2	Q16842	350 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	C14orf80	Q86SX3	495 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	DGKH	Q86XP1	1220 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	PHKB	Q93100	1093 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	PDE8B	O95263	885 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	FPR3	P25089	353 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	GATM	P50440	423 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF81	P51508	661 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	GALE	Q14376	348 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	FAM187B	Q17R55	369 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	MTX3	Q5HYI7	312 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	SNX22	Q96L94	193 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	MMS19	Q96T76	1030 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MATR3-223	ENST00000514402	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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