RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CAMK1Q14012 370 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SSPNQ14714 243 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 VMACQ2NL98 169 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 MFSD4BQ5TF39 518 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 DCAF12L1Q5VU92 463 aa2.5□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 TLR9Q9NR96 1032 aa2.5□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 NEU2Q9Y3R4 380 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SNX8Q9Y5X2 465 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SCAPERQ9BY12 1400 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 NLRP1Q9C000 1473 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 PTPRKQ15262 1439 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1B0GTL3 188 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 H7C0S8 307 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 FCHO1O14526 889 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 N4BP3O15049 544 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 RASSF9O75901 435 aa2.49□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 VIPP01282 170 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CKBP12277 381 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 ATP5JP18859 108 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 KRT20P35900 424 aa2.49□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 CAP1Q01518 475 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 MESP2Q0VG99 397 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CLCA4Q14CN2 919 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 TIGD6Q17RP2 521 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa2.49□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 MFSD5Q6N075 450 aa2.49□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 NDC1Q9BTX1 674 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 MLXIPQ9HAP2 919 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa2.49□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 GAGE10A6NGK3 116 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 HMX3A6NHT5 357 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 B5MCH6 92 aa2.49□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 E7ENX8 843 aa2.49□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 TULP3O75386 442 aa2.49□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 ZNF750Q32MQ0 723 aa2.49□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 METTL24Q5JXM2 366 aa2.49□□□□□ -2.01
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