RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 KBTBD13C9JR72 458 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PRPSAP2O60256 369 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 APOC2P02655 101 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CTSHP09668 335 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ADORA2BP29275 332 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SDC4P31431 198 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ATP1A2P50993 1020 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 IRAK1P51617 712 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 KCNA10Q16322 511 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 P3H1Q32P28 736 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RAB6CQ53S08 254 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC31Q6UY01 552 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SLC26A9Q7LBE3 791 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 OSTM1Q86WC4 334 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ACTL9Q8TC94 416 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 HSPH1Q92598 858 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 HAUS1Q96CS2 278 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PGM2Q96G03 612 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 HSFY1Q96LI6 401 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PCDH9Q9HC56 1237 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GABRDO14764 452 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 NDC80O14777 642 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GPR182O15218 404 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CAND2O75155 1236 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DESP17661 470 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MLH1P40692 756 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PTPN9P43378 593 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ACADSBP45954 432 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DYNLT1P63172 113 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GNGT1P63211 74 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ZSCAN26Q16670 478 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CDO1Q16878 200 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 BOLA3Q53S33 107 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PRUNE1Q86TP1 453 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 VSIG1Q86XK7 387 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RFX6Q8HWS3 928 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SLC2A14Q8TDB8 520 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TEKT4Q8WW24 435 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TBCBQ99426 244 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CEP290O15078 2479 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DNM1LO00429 736 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CYB561D2O14569 222 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TTC4O95801 387 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 THP07101 528 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CDH6P55285 790 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ATP11AP98196 1134 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PLCB3Q01970 1234 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DPYSL3Q14195 570 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PDK2Q15119 407 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MAP7D3Q8IWC1 876 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GAD1Q99259 594 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CALN1Q9BXU9 219 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PTPRDP23468 1912 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ARL5CA6NH57 179 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SGK1O00141 431 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MDM4O15151 490 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF623O75123 536 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ETS1P14921 441 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 HPDP32754 393 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ACLYP53396 1101 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
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