RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498804.1

TRBVA-201, Transcript of T cell receptor beta variable A (pseudogene), humanhuman

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Gene TRBVA, Length 316 nt, Biotype TR V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBVA-201ENST00000498804 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 M0R3H8 397 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PSMD9O00233 223 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ADAMTS3O15072 1205 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SPRY2O43597 315 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 MOSPD3O75425 235 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ZBED1O96006 694 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PHKG2P15735 406 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 RHCEP18577 417 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PEX2P28328 305 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 NTSR1P30989 418 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 MMP13P45452 471 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 RENBPP51606 427 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 RHDQ02161 417 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SEMA5AQ13591 1074 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 RAB32Q13637 225 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 FHL3Q13643 280 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 KCNAB1Q14722 419 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 KIAA0753Q2KHM9 967 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CACHD1Q5VU97 1274 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 DENND2CQ68D51 928 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 IGFBPL1Q8WX77 278 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SPSB4Q96A44 273 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 APIPQ96GX9 242 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 MMS19Q96T76 1030 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 TMEM79Q9BSE2 394 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PRSS22Q9GZN4 317 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CHST8Q9H2A9 424 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PDGFCQ9NRA1 345 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 TPCN1Q9ULQ1 816 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 BTBD19C9JJ37 291 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PARNO95453 639 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 HRGP04196 525 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 IGKV2-30P06310 120 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 KLRC1P26715 233 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 UQCRC1P31930 480 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 MCM5P33992 734 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 BCAT1P54687 386 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 LAMB3Q13751 1172 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CERCAMQ5T4B2 595 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 FMNL3Q8IVF7 1028 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SPARTQ8N0X7 666 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SIRT6Q8N6T7 355 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF366Q8N895 744 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 TERB1Q8NA31 727 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 C8orf58Q8NAV2 365 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PIGOQ8TEQ8 1089 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SUCLG2Q96I99 432 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 TRIM5Q9C035 493 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 RIMKLBQ9ULI2 386 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF521Q96K83 1311 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ISM1B1AKI9 464 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 RAB27BO00194 218 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PPEF2O14830 753 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 EXOC3O60645 756 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PMPCBO75439 489 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 RASAL1O95294 804 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 TXNP10599 105 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ATF3P18847 181 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PRKAR1BP31321 381 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 GKP32189 559 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 DEUP1Q05D60 604 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CCNIQ14094 377 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SEC23BQ15437 767 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ETFDHQ16134 617 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 INSCQ1MX18 579 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF750Q32MQ0 723 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SLC2A7Q6PXP3 512 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.5□□□□□ -1.85
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