RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 GALNT4Q8N4A0 578 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 FAM156AQ8NDB6 213 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 C16orf52Q8NHV5 167 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 LYZL4Q96KX0 146 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 NT5C1BQ96P26 610 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 CIPCQ9C0C6 399 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 SIK2Q9H0K1 926 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 WDCPQ9H6R7 721 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 CXorf36Q9H7Y0 433 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 SLC52A1Q9NWF4 448 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 STAP2Q9UGK3 403 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 PCDHA6Q9UN73 950 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 FAM50BQ9Y247 325 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 POLHQ9Y253 713 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 TTC3P53804 2025 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 FAM227AF5H4B4 570 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 H3BUI4 141 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 H7C1Q1 480 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 TPP1O14773 563 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 TJP3O95049 919 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 ALPLP05186 524 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 KRT18P05783 430 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 GRPP07492 148 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 TMEM191BP0C7N4 346 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 PPIFP30405 207 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 THBS3P49746 956 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 RAB1AP62820 205 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 MYO1EQ12965 1108 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 IQCB1Q15051 598 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 SEC23BQ15437 767 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 LAYNQ6UX15 382 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 CCDC149Q6ZUS6 474 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 DAAM2Q86T65 1068 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 KRT78Q8N1N4 520 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 ABHD11Q8NFV4 315 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 SOCS4Q8WXH5 440 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 SLC35A4Q96G79 324 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 SNX18Q96RF0 628 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 PRR25Q96S07 402 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 TMEM60Q9H2L4 133 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 FAM204AQ9H8W3 233 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 ARNT2Q9HBZ2 717 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 PNPOQ9NVS9 261 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 GABRQQ9UN88 632 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 PROCRQ9UNN8 238 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 SNX14Q9Y5W7 946 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 CAPN8A6NHC0 703 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 APAF1O14727 1248 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 ZBED1O96006 694 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 MYL1P05976 194 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 KRT10P13645 584 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 RHCEP18577 417 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 SOX8P57073 446 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 RHDQ02161 417 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 E2F2Q14209 437 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 FAM187BQ17R55 369 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 KIAA0753Q2KHM9 967 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 PTCHD3Q3KNS1 767 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 ANO6Q4KMQ2 910 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 COBLL1Q53SF7 1204 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 C10orf25Q5T742 122 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 PPP4R4Q6NUP7 873 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 Q6ZTC4 211 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 USP43Q70EL4 1123 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 TMEM171Q8WVE6 324 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 FAM118BQ9BPY3 351 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 SARGQ9BW04 601 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 CHST12Q9NRB3 414 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 TXLNGQ9NUQ3 528 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-242ENST00000498280 XPR1Q9UBH6 696 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms