RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497870.1

PLS3-208, Transcript of plastin 3, human

TSL 4

Gene PLS3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLS3-208	ENST00000497870	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	PIAS2	O75928	621 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	KCNA2	P16389	499 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	LNX2	Q8N448	690 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	RUBCN	Q92622	972 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870		Q96MF0	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PLS3-208	ENST00000497870		A0A1W2PS29	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870		H7C4K7	107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	TRIM38	O00635	465 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	NCAM2	O15394	837 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	RGS10	O43665	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	TRIAP1	O43715	76 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	VPS4B	O75351	444 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	RASAL1	O95294	804 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	VIP	P01282	170 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	ATIC	P31939	592 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	DGKE	P52429	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	PRKAG1	P54619	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	MPP3	Q13368	585 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	E2F2	Q14209	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	POSTN	Q15063	836 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870		Q6ZNX1	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PLS3-208	ENST00000497870	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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