RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492182.5

XPO1-222, Transcript of exportin 1, human

TSL 2

Gene XPO1, Length 827 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XPO1-222	ENST00000492182	TNNC2	P02585	160 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	CYP17A1	P05093	508 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	PDGFRB	P09619	1106 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	ADH5	P11766	374 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	IDE	P14735	1019 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	P2RY2	P41231	377 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	ZNF131	P52739	623 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	ANO4	Q32M45	955 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	OSTM1	Q86WC4	334 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	NAT16	Q8N8M0	369 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	HVCN1	Q96D96	273 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	MYRFL	Q96LU7	910 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		10.65	□□□□□ -0.7
XPO1-222	ENST00000492182	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182		H0Y626	953 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	SGK1	O00141	431 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	ATP2C2	O75185	946 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	NDUFS2	O75306	463 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	TRIM16	O95361	564 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	IRF1	P10914	325 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	ITPKA	P23677	461 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	GJB2	P29033	226 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	TXLNA	P40222	546 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	WAS	P42768	502 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	DHCR24	Q15392	516 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	EMC10	Q5UCC4	262 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	SDE2	Q6IQ49	451 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	CEP76	Q8TAP6	659 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	LRRC15	Q8TF66	581 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	FAM84A	Q96KN4	292 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	SNX25	Q9H3E2	840 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	GCNT4	Q9P109	453 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	CDH9	Q9ULB4	789 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		10.64	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	BMP15	O95972	392 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	SYP	P08247	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	HOXB2	P14652	356 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	MAGEA11	P43364	429 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	WNT7B	P56706	349 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	GAD2	Q05329	585 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	VSTM1	Q6UX27	236 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	ZNF516	Q92618	1163 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	HPDL	Q96IR7	371 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	FNBP1	Q96RU3	617 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		10.63	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		10.62	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182		F8VP50	259 aa		10.62	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	TCF3	P15923	654 aa		10.62	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	GAP43	P17677	238 aa		10.62	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	PFKL	P17858	780 aa		10.62	□□□□□ -0.71
XPO1-222	ENST00000492182	LMO2	P25791	158 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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