RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	TLE2	Q04725	743 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC63	Q05C16	580 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAM9	Q13443	819 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	LPIN1	Q14693	890 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM60	Q495X7	471 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	HVCN1	Q96D96	273 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFT74	Q96LB3	600 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDT1	Q9H211	546 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	THAP9	Q9H5L6	903 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SP110	Q9HB58	689 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLEC1B	Q9P126	229 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE4B	O95155	1302 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1B0GUA9	196 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	BLACE	A4D250	179 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNJ18	B7U540	433 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	NBN	O60934	754 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADCY5	O95622	1261 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	WNT11	O96014	354 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM49	P0CI25	452 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM49C	P0CI26	452 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CKB	P12277	381 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAM	P19021	973 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	NR2F2	P24468	414 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRE11	P49959	708 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNM2	P50570	870 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	MCL1	Q07820	350 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP3CA	Q08209	521 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUSP4	Q13115	394 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNAB2	Q13303	367 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALCAM	Q13740	583 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNJ12	Q14500	433 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	NR1I3	Q14994	352 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP2R5A	Q15172	486 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	MBLAC2	Q68D91	279 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	IQCE	Q6IPM2	695 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF410	Q86VK4	478 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	LMO3	Q8TAP4	145 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CXorf38	Q8TB03	319 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTPRN2	Q92932	1015 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC35C1	Q96A29	364 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	VPS16	Q9H269	839 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFNK	Q9P0W0	207 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	GINS2	Q9Y248	185 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLAA	Q9Y263	795 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		6.66	□□□□□ -1.34

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